村"两委"关系问题的实质,即是对"村民自治会影响党的领导"的疑虑。学界对此一直缺乏系统而扎实的研究,进而形成必要的学术共识。借助质化与量化相结合的调查数据,通过对乡村居民对于村党组织在村选举的实然作用与应然作用、村"一把手"的实际对象与应然对象、村选举对村"两委"关系的影响的认知或评价等维度分析,发现乡村居民对于村党组织和村支书的地位与作用的认知与评价,并未因村民选举、村民自治而改变。也就是说,村民自治并未影响到"党的领导",党在乡村的领导权威和地位拥有深厚的民意基础。他们较为普遍地认同"两票制",并不支持"一肩挑"模式。尤其重要的是,他们所持意见的多种理据切合现代政治的常识性原理,如对选举的正当性价值、选举权及其程序价值、选举的工具价值,对政治生活中分工与效能、权力监督与制衡、科学决策与协商等现代政治常理的认同与支持。显然,这种民意状况,正是巩固党的执政合法性的重要基础,也是对村民自治与民主发展的有力支持,更是对精英或威权取向政治的强力驳斥。