【摘 要】
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杂交育种应用于农业生产有着几千年的悠久历史,杂交优势的科学研究也持续了一个多世纪.斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)与鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)的杂交子
【机 构】
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中山大学生命科学学院水生经济动物研究所,广东广州,510275
【出 处】
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第五届“全国石斑鱼类繁育与养殖产业化”论坛
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杂交育种应用于农业生产有着几千年的悠久历史,杂交优势的科学研究也持续了一个多世纪.斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)与鞍带石斑鱼(Epinephelus lanceolatus)的杂交子一代青龙石斑鱼表现出生长速度快、存活率高等特点.本研究利用生物信息学技术对两种杂交青龙石斑鱼及其亲本的转录组测序数据进行处理,从基因差异表达、差异表达基因模式聚类和功能注释、SNV基因分型等不同角度了展开初步分析和研究.在脑、肝脏和性腺三个组织中分别检测到差异表达的基因7809个、25016个和60253个.Kegg分析发现在生殖相关的通路中,对比二倍体,三倍体青龙石斑鱼基因的表达出现一定程度上的紊乱,暗示可能与三倍体性腺发育迟滞相关.经过对SNV进行一系列筛选、比对和基因分型,在青龙二倍体脑、肝、性腺中分别得到811、4005、1444个表达基因可以确定其亲本来源,在青龙三倍体中分别有1868、1015、2224个分型基因.本研究对杂交石斑鱼转录组数据进行分析,为石斑鱼研究探索了新的研究手段,并提供了转录组水平的数据支持.
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