糖链在生命活动中具有非常重要的作用。糖基化影响蛋白的折叠、稳定性、信号传导、生物活性、免疫原性及药代动力学等。目前大多数糖蛋白疫苗可以延长蛋白的半衰期、提高蛋白的可溶性和稳定性、改善蛋白的免疫原性和效价。糖蛋白疫苗主要包括两种,一种是多糖抗原与载体蛋白共价结合的多糖蛋白结合疫苗。这种疫苗能够产生长久免疫保护效果,如:Hib多糖结合疫苗,脑膜炎奈瑟球菌多糖结合疫苗,肺炎球菌多糖结合疫苗,百日咳博得特氏菌和白色念珠菌抗菌疫苗等。糖蛋白可使机体产生免疫记忆和更加高效的保护性抗体效价,因此多糖结合疫苗被认为是人类最成功的疫苗。目前有两种已进入临床试验,一个是痢疾志贺氏菌Ⅰ型结合疫苗,另一个是针对金黄色葡萄球菌的荚膜多糖结合疫苗。另一种糖蛋白疫苗是抗原蛋白与多糖分子共价结合的糖修饰蛋白结合疫苗。这种疫苗影响蛋白的抗原性和免疫原性,并增强了疫苗的稳定性,如:乙肝病毒表面抗原HBsAg的疫苗和H5N1亚型禽流感病毒的HA(血凝素蛋白)抗原等。糖修饰蛋白结合疫苗能够产生中和抗体,使机体在病毒进入细胞之前破坏病毒,预防病毒的感染,如;汉坦病毒包膜糖蛋白重组假病毒疫苗,它可以产生与灭活疫苗水平相当的特异性抗体和高于灭活疫苗的中和抗体。