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CA16病毒作为手足口病主要病原之一，其病原学性状与感染引起的病理过程具有可能的相关意义。对分离自一名重症手足口病(HFMD)患者咽拭子的两株呈现不同蚀斑形态的CA16毒株所做的生物学分析表明，它们在其增殖动力学、免疫原性等生物学性状上的差异，与其对乳鼠致病能力的差异具有相关性，而这些共同的差异与病毒基因非编码区5—端序列及结构区的VP1区域中的序列之间存在着可能的对应关系，所有这些结果提示了CA16病毒生物学及遗传学性状与其致病能力的相关性。