肠黏膜的完整性依赖于对脱落的上皮细胞的不断更新,处于隐窝处的肠干细胞(IntestinalStem Cell,ISC)不断分裂为具有增殖能力的祖细胞群,这群祖细胞一部分向绒毛顶端迁移,迁移的过程中分化为成熟的肠上皮细胞,包括杯状细胞、吸收细胞及肠内分泌细胞；另一部分则向隐窝处迁移,分化为Paneth细胞以构成肠干细胞增殖及分化的“龛”。正常肠上皮细胞更新速度较快,约72-96小时更新一次。放射性肠损伤为腹盆部肿瘤放射治疗常见的并发症,射线主要作用于隐窝处分裂旺盛的ISC细胞,打破了黏膜上皮再生系统的平衡,导致肠绒毛变短甚至脱落,隐窝数量减少甚至消失。肠上皮内淋巴细胞具有胸腺外发育的特征(CD8α α阳性)，肠上皮细胞分泌的IL-18等细胞因子可以促进此类淋巴细胞发育成熟，对肠免疫屏障的维护具有重要作用。肠黏膜上皮的完整性对肠屏障功能的恢复具有重要意义。