【摘 要】
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To understand the molecular basis of sugarcane-smut interaction, it is important to identify sugarcane genes respond to the pathogen attack.High-throughput tag-sequencing (tag-seq) analysis by Solexa
【机 构】
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Key Laboratory of Sugarcane Biology and Genetic Breeding, Ministry of Agriculture / Fujian Agricultu
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To understand the molecular basis of sugarcane-smut interaction, it is important to identify sugarcane genes respond to the pathogen attack.High-throughput tag-sequencing (tag-seq) analysis by Solexa technology was performed on sugarcane infected with S.scitaminea, which should have massively increased the amount of data available for transcriptome profile analysis.After mapping to sugarcane EST databases in NCBI, we obtained 2015 differentially expressed genes, of which 1125 were up-regulated and 890 down-regulated by infection.Gene ontology (GO) analysis revealed that the differentially expressed genes involve in many cellular processes.
其他文献
[研究背景]合理的耕作措施有利于协调土壤中的水、肥、气、热之间的关系,增强作物抗逆能力,为作物生长发育创造适宜环境,保证作物持续高产、稳产.本研究设计3种不同的耕种方式,通过田间原位监测,探讨不同耕作方式下的土壤水分与温度动态变化特征,及其对玉米产量的影响,以期为东北春玉米农田蓄水保温的土壤耕作方式调整提供理论参考和技术支撑.
抗坏血酸过氧化物酶(APX)在植物响应逆境胁迫中具有重要作用.根据苎麻转录组测序中的Unigene42508片段序列,通过RT-PCR结合RACE技术从中苎1号苎麻品种中克隆该基因的全长cDNA序列.BLAST分析表明,该基因编码蛋白属于植物过氧化物酶超家族成员,将其命名为BnAPX1.其cDNA全长为1 201 bp,含有一个870 bp的开放阅读框,编码一个含289个氨基酸残基,分子量为31.
以湘苎3号为材料,从苎麻转录组中获得一个与E3泛素连接酶高度相似Unigene13187,该Unigene在赤霉素处理苎麻表达谱中下调表达,利用该序列的上下游设计引物,结合RT-PCR技术,克隆得到其全长开放读码框序列924bp,编码307个氨基酸,其编码蛋白质的等电点和分子量分别为7.779 kD和34.466 kD,与毛果杨、大豆、百脉根的SINAT2基因核苷酸相似性分别是83％、80％、79
赣抚平原是位于江西省中部偏北的赣江和抚河下游的三角洲平原地带,属于河流冲积平原,土地肥沃,是江西省的水稻主产区.近年来,针对这一区域双季稻田的土壤微生物学研究取得了一定的进展,在前人研究基础上,本研究应用宏蛋白组策略,对不同施肥制度下水稻根际土壤蛋白的差异表达进行研究,探讨了不同施肥制度对水稻生长产生影响的机理.
Catalase is an iron porphyrin enzyme, which serves as one of the efficient scavengers of reactive oxygen species (ROS) which can convert H2O2 into water and oxygen.During the developmental processes o
花生在整个生育时期会遭受到各种环境胁迫,其中温度就是影响花生生长发育的重要因素之一.花生播种后常遭遇低温威胁,这种灾害的发生生理表现为:生长缓慢,代谢弱,根系吸水减少,蒸腾作用减弱,植株单位时间内的生物量小,最终导致产量的降低.花生在我国种植范围较广泛,北方已种植到黑龙江省黑河市(北纬50°).
K+/Na+ homeostasis regulated by HKT transporters is considered as a key component of salinity tolerance in plants.In the previous studies, we identified some Tibetan wild barley accessions with higher
Cytoplasmic male sterility (CMS) is a widespread phenomenon in higher plants, and some studies have established that this maternally inherited defect is often associated with a mitochondrial mutant.A
由Ralstonia solanacearum引起的花生青枯病是我国花生上的一种毁灭性病害.通过轮作、化学药剂和生物防治能够在一定程度上预防青枯病的发生,但是这些方法浪费土地资源,并且增加了种植成本.选育和种植抗青枯病花生品种是目前最为经济有效的防治途径.花生栽培种基因组庞大,且含有较多重复序列.虽然近年来有不少关于花生青枯病抗性基因分子标记的报道,但是这些分子标记与抗性间的图距较大,实用价值不大
橡胶是我国的重要物质.巴西橡胶树是一种重要的产胶植物,也是我国热带、亚热带地区重要的经济作物.用分子标记方法构建橡胶树的连锁群或遗传图谱难度大,现有的橡胶树连锁遗传图少而且是从总基因组中获得,并有连锁群不稳定,连锁标记少且分布不均匀,无法确定许多重要基因在染色体上的位置和分布特点.构建橡胶树单染色体文库,可以有效的解决上述问题.本实验以巴西橡胶树热研7-33-97幼叶为材料,采用酶解去壁低渗法,建