根据溶藻弧菌外膜蛋白W基因的保守序列设计引物,扩增溶藻弧菌外膜蛋白W的主要区域,再根据该序列两端分别设计三个嵌套的特异性引物,与随机引物组合进行热不对称交错PCR(TAIL-PCR)。经三次热不对称交错PCR后,成功扩增出外膜蛋白W完整开放阅读框,测序分析表明该外膜蛋白W的开放阅读框长度为645bp,与GenBank中登录的DQ075316.1,AY944132.1同源性分别为99%,90%。该基因编码214个氨基酸,其信号肽含有22个氨基酸残基。通过基因重组构建原核表达载体PET-OMPW,转化大肠杆菌BL21后用IPTG进行诱导表达,SDS-PAGE电泳结果表明诱导的目的蛋白约为23KD,与理论推导的一致。该基因的氨基酸序列同登录号为AAY86764.1的溶藻弧菌的同源性为95%,与发光菌属和哈维氏弧菌的同源性分别为92%和86%。实验结果表明,溶藻弧菌外膜蛋白W与其它弧菌属外膜蛋白具有较高同源性,可以作为研制DNA疫苗的抗原基因,为进一步研究DNA疫苗提供理论依据。