麻疯树(Jatropha curcus L.)是一种高含油率、耐贫瘠的能源植物.盐胁迫是影响植物生长及产量的最严重的非生物胁迫之一.然而，在全基因组水平上麻疯树对盐胁迫响应的研究还没有报道.本研究利用高通量测序技术来研究麻疯树幼苗在正常营养条件和盐胁迫2h、2d、4d、7d 四个时间点和根、茎、叶三个组织的全基因组表达谱.通过生理指标测定发现：盐胁迫使麻疯树叶片的光合能力降低，细胞膜透性增大，各组织磷含量增加，氮含量降低.通过对差异表达基因个数统计发现根和茎在早期2h 响应基因较多，叶在后期响应基因较多.通过对差异表达基因参与的代谢途径分析发现：麻疯树通过SOS 和ABA 依赖的信号途径以及BR 和ET 途径来共同感知并传递盐胁迫信号；通过增加渗透调节物质与次生代谢物合成，增强水孔蛋白基因表达，以及加强活性氧清除酶系来减轻渗透胁迫与氧化胁迫对细胞造成的伤害；此外，细胞骨架相关基因在根茎叶中差异表达，这对保持正常的细胞结构、物质运输与信息传递具有重要作用；最后我们还发现，盐胁迫下，麻疯树中磷吸收转运相关基因表达增强，这与盐胁迫下植株磷含量增加的结果相一致；麻疯树种子发育后期显著上调的基因在盐胁迫后期也上调表达，这与两个条件下麻疯树合成的ABA参与渗透调节相关，对麻疯树耐盐具有重要意义.