【摘 要】
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F5H是调控木质素代谢的关键酶之一,在S型木质素合成中起限速作用。对F5H基因家族进行鉴定及生物信息学分析,解析石榴F5H基因家族的特征。利用已公布的石榴基因组及NCBI数据,
【基金项目】
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山东省重点研发计划项目(2018GNC111009);山东省农业科学院农业科技创新工程学科团队(CXGC2018E22);山东省农业良种工程南种北繁项目(2017LZN023)
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F5H是调控木质素代谢的关键酶之一,在S型木质素合成中起限速作用。对F5H基因家族进行鉴定及生物信息学分析,解析石榴F5H基因家族的特征。利用已公布的石榴基因组及NCBI数据,鉴定石榴F5H基因家族成员;通过生物信息学手段,对其理化性质、系统进化关系、二级结构、三级结构、亚细胞定位、蛋白质磷酸化和保守基序等进行预测与分析。从石榴中鉴定出25个F5H基因家族成员,其理化性质存在一定差异。以碱性氨基酸为主,大部分为不稳定蛋白和亲水性蛋白。F5H基因分为3个亚族,以第3亚族数量最高。二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲元件构成,聚在同一亚族蛋白的三级结构相似。F5H蛋白主要存在于内质网中,有丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸3个磷酸化位点。具有相似保守基序的F5H基因聚在同一亚族,进化关系较近。本研究为石榴F5H基因家族功能的深入研究奠定了理论基础,对揭示石榴木质素代谢机理具有一定理论参考价值。
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