水禽呼肠孤病毒诊断和分型RT-PCR的建立

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引言番鸭、北京鸭、麻鸭和鹅等不同品种水禽均可感染呼肠孤病毒并发病。进化分析结果显示,来自不同水禽的呼肠孤病毒(ARV-Wa)分属两个不同的基因型[1-3]。本研究旨在建立ARV-Wa诊断和分型RT-PCR,以便对ARV-Wa进行快速检测和分型。材料与方法针对呼肠孤病毒基因组保守区筛选诊断RT-PCR引物,针对基因组高变区筛选型特异性引物。以基因1型815-12株和基因2型J18株作为参考毒株,分别建立诊断RT-PCR和基因1型和2型特异性RT-PCR。以2个型鸭甲肝病毒、3个型鸭星状病毒和坦布苏病毒为对照,测试方法的特异性。结果经条件优化,分别建立了诊断RT-PCR、基因1型和2型特异性RT-PCR。用诊断RTPCR进行检测,可以从ARV-Wa基因1型815-12株和基因2型J18株中扩增出719bp的目的条带。用ARV-Wa基因1型和2型特异性RT-PCR进行检测,分别从基因1型815-12株和基因2型J18株中扩增出315 bp和465 bp的条带。扩增其它病毒时均为阴性。敏感性试验结果显示,3种RT-PCR均具有良好的敏感性。讨论本研究基于保守区建立的诊断RT-PCR,可用于ARV-Wa分离株的鉴定和感染样品中病毒的检测。基于变异区建立的分型RT-PCR,可用于ARV-Wa分离株的分型,亦可对感染样品中所含毒株进行快速分型。结论建立了ARV-Wa的诊断和分型RT-PCR检测方法 。
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