根据长江口及邻近海域（包括长江口、杭州湾和舟山渔场）在2007~2009年春、夏2季的调查监测资料,利用富营养指数法、潜在性富营养化法和有机污染指数法对该海域的富营养化情况、分布特征及与盐度、溶解氧和p H值的关系进行了分析评价,同时将3种方法的结果进行了比较分析。通过富营养指数法计算发现,富营养化覆盖比例最低值为70.0%,出现在2007年春季的杭州湾,富营养化覆盖比例较高;总体上,该海域在春季的富营养化覆盖程度呈现上升趋势,2007年为77.0%上升到2009年的89.8%,夏季富营养化覆盖比例明显高于春季,最低值为89.3%,最高到100.0%。在春季,3年来富营养化比例分别从77.0%上升到83.7%,最后到89.8%;在夏季从89.3%上升到100.0%再到97.2%;总体上春、夏2季基本上处于逐年增加趋势,说明富营养化覆盖面越来越大,水域受富营养化的程度也越来越严重。在春季富营养指数平面分布呈由近岸向远海逐渐递减的趋势,梯度分布明显,指数最高值区出现在西部近岸方向,处于杭州湾近岸水域;夏季其平面分布与春季类似,南北方向伸展并向东扩散、衰减,梯度分布明显,但长江口和杭州湾两个水域的富营养指数的等值线都比较密集,夏季的富营养化情况较为严重。该海域富营养级主要处于ⅡI级（富营养）和V P级（磷中等限制潜在性富营养）,富营养化程度较高,与富营养指数法的评价结果一致;另外,受磷限制性富营养化程度逐年增加;营养盐结构不平衡,N/P比值偏离较明显,势必影响浮游生物的生长。该海域有机污染指数主要处于5级（重污染）,水质污染严重,与富营养指数法和潜在性富营养化法分析统计结果相吻合。3年来春、夏2季长江口有机污染指数达5级的占50%以上,杭州湾60%以上,舟山渔场20%以上,杭州湾受污染情况最为严重,其次是长江口,舟山渔场最小。富营养指数和有机污染指数与盐度、溶解氧、p H无明显的线性相关性。调查海域富营养化水平的时空变化主要是由于沿岸入海河流,浮游植物等所引起。