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为了监测原水中微囊藻的变化趋势，欲通过本实验建立快速的微囊藻检测方法。使用了针对微囊藻16S rDNA基因的引物进行了qRT-PCR定性定量检测，并以一株铜绿微囊藻培养物的细胞数目和qRT-PCR的Ct值制作了标准曲线，获得了较好的线性关系；微囊藻纯培养物之镜检结果与qRT-PCR结果也较相近。另外也采用了水华鱼腥藻及拟柱孢藻两种蓝绿藻培养物与微囊藻培养物混合后进行了特异性测试，结果发现扩增结果未因有其它藻类的存在而受到太大的影响。从2006年9月至2007年6月，对四个原水水体的微囊藻进行了定性分析，并尝试以该标准曲线对原水水样的微囊藻进行初步的定量检测。