【摘 要】
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为了进一步探究捕食线虫性真菌对线虫的致病分子机理及其相关致病因子,本研究从已公布的少孢节丛孢菌全基因组序列中选取其2种粘附蛋白序列,以此设计2对特异性引物,通过PCR方法对少孢节丛孢菌新疆分离株A1的两个粘附蛋白基因序列进行扩增,利用生物信息学软件进行序列同源性分析,并对其编码蛋白二级结构和功能位点进行预测.结果显示,ADP1的基因序列全长为468bp,编码155个氨基酸,与已公布的同源基因序列同
【机 构】
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石河子大学动物科技学院/预防兽医学重点实验室,新疆石河子832003 中国农业科学院兰州兽医研究所
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第七次代表大会暨第十二次学术研讨会
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为了进一步探究捕食线虫性真菌对线虫的致病分子机理及其相关致病因子,本研究从已公布的少孢节丛孢菌全基因组序列中选取其2种粘附蛋白序列,以此设计2对特异性引物,通过PCR方法对少孢节丛孢菌新疆分离株A1的两个粘附蛋白基因序列进行扩增,利用生物信息学软件进行序列同源性分析,并对其编码蛋白二级结构和功能位点进行预测.结果显示,ADP1的基因序列全长为468bp,编码155个氨基酸,与已公布的同源基因序列同源性为96.37％,氨基酸序列同源性为94.19％,其中有9个氨基酸发生变异；ADP2的基因序列全长为1485bp,与已公布的同源基因的同源性为97.72％,序列中含有2个内含子序列,分别位于其序列的370～437位和824～878位核苷酸,大小为68bp和55bp,内含子序列均已GT开头,AG结尾,具有真菌内含子的共同特征；ADP2包括453个氨基酸,与以公布的氨基酸序列同源性为98.23％,其中有6个氨基酸出现突变.利用生物学软件对ADP1和ADP2的结构与功能预测结果显示,这2种蛋白质的二级结构均主要以α-螺旋、延伸链及无规则卷曲为主；在ADPl中,其序列的93-115位氨基酸可形成一个跨膜结构,在ADP2中,其序列的143-436位氨基酸属于粘附蛋白家族的Bystin结构域.对捕食线虫性真菌粘附蛋白基因的克隆和生物信息学分析有助于真菌对线虫的致病分子机理研究,为利用捕食线虫性真菌对线虫病进行生物防控具有重要的意义.
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