【摘 要】
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为了丰富紫花苜蓿(Medicago sativa)转录组数据信息,找出不同品种紫花苜蓿的差异基因。本研究通过Illumina HiSeq 4000平台对准格尔和WL319HQ的苜蓿叶片的RNA文库进行de novo
【机 构】
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内蒙古农业大学草原与资源环境学院;
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为了丰富紫花苜蓿(Medicago sativa)转录组数据信息,找出不同品种紫花苜蓿的差异基因。本研究通过Illumina HiSeq 4000平台对准格尔和WL319HQ的苜蓿叶片的RNA文库进行de novo组装。我们得到了约39G总的核苷酸,2亿多个reads,组装得到66734个unigenes,平均长度为869bp。将所得到的Unigenes与Nr,SwissProt,KOG和KEGG数据库比对,分别获得44888(67.26%),29190(43.74%),24844(37.23%)和15647(23.45%)条序列的注释信息。在2个紫花苜蓿叶片中找到1098个差异基因(DEGs),其中有706个unigenes上调,392个unigenes下调(准格尔-vs-WL319HQ)。本研究为紫花苜蓿的转录组测序提供理论依据。
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