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本课题组选取了中国不同省份、区域的32个农田耕作土壤，采用16S rRNA和功能基因克隆文库构建、实时定量PCR技术，结合D0TUR和CANOCO生物统计软件研究了32个区域的农田耕作土壤中anammox菌的种群多样性、种群数量、种群分布及影响的主要环境因子，研究结果表明在32个农田土壤样品中可检测到4种anammox菌，其中Candidates Brocadia是优势种;定量PCR结果表明anammox菌的数量在104-106拷贝/克干重;土壤氨氮和土壤有机质含量是影响anammox菌种群和数量的主要环境因子。课题组还采用了功能基因的高通量测序结合定量PCR技术研究了32个农田土壤样品中AOB和AOA的种群组成、分布和影响因素。