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随着社会经济的快速发展和科学技术的快速进步，新型农村合作医疗体系在我国得到了很大的发展，新型农村合作医疗体系在我国的医疗事业中的地位越来越重要，本文着重阐述江苏省新型农村合作医疗在三级医院的应用以及新农合结算系统与HIS 系统的接口方式，采用Web 数据交换平台与接口两种连接方式，新农合的及时结算大大方便了参合人员的就医。