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采用了不依赖于培养技术的可用于环境样品的16S rDNA 克隆文库方法,限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)方法,对采自东乡铜矿(江西省),银山铅锌矿(江西省), 云浮硫铁矿(广东省),中条山铜矿(山西省),大冶铜绿山铜矿(湖北省)等地的酸性矿山废水样品进行了微生物生态多样性分析。结果发现:不同来源的酸性矿山废水样品中微生物组成存在很大差异,有些样品中存在古菌,有些则无古菌。酸性矿山废水样品中检测到的细菌主要分为3大类:Proteobacteria,Nitrospira 和 Firmicutes。从来自东乡铜矿,银山铅锌矿和大冶铜绿山铜矿的酸性矿山废水样品中检测到了古菌。检测到的古菌主要是 Thermoplasma 和 Ferroplasma 属的,Sulfolobales 和 Methanothermus 属的古菌也有少量被检测到。通过样品地球化学性质与微生物组成的相关性研究发现,高浓度的 As 及其他金属离子比如 Cu,Fe,Zn 和 Ag 等似乎对样品中微生物群落结构起着重要的决定作用,尤其是对一些典型的铁氧化细菌(比如 Acidithiobacillus ferrooxidans(A.f)和 Leptospirillum 属的菌种)。