从生理学角度分析“猪越来越难养”的症结，认为问题的源头主要包括以下两个方面。一是抗生素的滥用严重破坏了猪的微生态平衡；二是发育关键“窗口期”应激增加了疾病易感性。猪并不是独立存在的个体，而是与数量庞大、种类繁多的微生物和谐共存的“超级有机体” ( Superorganism)。抗生素的滥用一方面导致细菌耐药性，更重要的是破坏了机体的微生态平衡，甚至导致肥胖、炎症和精神障碍。动物发育的“关键窗口期”是决定动物生长、免疫、繁殖，以及应激敏感性等生理功能的关键控制点。发育的“窗口期”指胚胎期和新生期，也是一个动物体从一个单细胞受精卵发育形成结构正常、功能完善的各种重要器官的关键时期。研究表明，发育“关键窗口期”的环境及营养状态对动物生长期和成年后的健康与福利状况起决定性的影响，并可能通过表观遗传机制传递到下一代。在养猪生产中，母猪和仔猪的健康是决定养猪效率的关键，而恰恰母猪和仔猪的健康问题最为严重。