【摘 要】
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为加快速度和减少猕猴桃属遗传图谱的构建开支,以及在育种和功能基因组学研究中的应用,本文从表达序列标记(ESTs)中筛选微卫星标记,并评价它们的发生频率和多态性水平。选择的微
【机 构】
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新西兰园艺与食品研究所 奥克兰艾伯特山120号
【出 处】
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中国园艺学会猕猴桃分会首届学术及产品发展研讨会
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为加快速度和减少猕猴桃属遗传图谱的构建开支,以及在育种和功能基因组学研究中的应用,本文从表达序列标记(ESTs)中筛选微卫星标记,并评价它们的发生频率和多态性水平。选择的微卫星标记具有很好的二核苷酸重复性,并在所表达基因的5和3端均有很多重复。微卫星的长度不等,但大多数是(CT)n/(GA)n的重复模式。150个微卫星标记,每个都有超过10次二核苷酸的重复单元,选择作为可能的标记。当这些序列扩增后,93.5%具多态性,在作图群体中呈分离状态,22.6%扩增具1个以上的位点。4种标记类型被鉴定,在整个标号中,有27%的为全信息标记,36.2%的为雌性标记,25.8%的为雄性标记,还有10%的为部分信息标记。作图群体为一个二倍体中华猕猴桃种间杂交,亲本选择注意其果实和植株特征的差异,以及地理上的隔离。用“Join-map”软件检验连锁关系,设置LOD值为3,在获得的连锁群中,由EST为基础的标记的分布呈现随机趋势。由于取样数量较少,连锁群数量(31)超过了染色体数(n=29),且很多标记根本不能分类。那些扩增位点多于1个的微卫星标记被分别作图到不同的连锁群中。根据我们对中华猕猴桃的研究,源自EST的微卫星标记可很快获得大量的潜在标记,且费用不是很高。标记都具高多态性,在作图群体中呈分离状态,可提供一些功能上的信息,增进基因组图谱的价值。
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