2013年以来,环形RNA(circular RNAs,circRNAs)成为非编码RNA领域一个新的研究热点。与所有现有的线性非编码RNA分子不同,环形RNA是一类由线性RNA通过3, 5-磷酸二酯键将两端相连而形成的RNA环状分子。我们针对环形RNA结构特点,基于环形RNA测序数据与基因组比对时产生的成对交叉剪切信号,建立了高效、无偏差的识别算法(CIRI)。同时,借助PEM、剪接位点以及重复序列分布等信息,构建了多重筛选策略,显著提高了预测灵敏度及准确度。通过比较ENCODE肿瘤及非肿瘤细胞系环形RNA组成及表达差异,我们发现不同肿瘤细胞系更倾向于具有不同的环形RNA组成和表达水平。广布性的环形RNA趋向于具有更高的表达水平,这揭示它们在细胞中可能发挥着重要的功能。此外,我们进一步揭示人细胞内有大约10-20％的环形RNA来源于基因组内含子或基因间区,它们为后续的功能验证提供了重要的靶点。