【摘 要】
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以北极海冰细菌Pseudoalteromonas issachenkonii A2为研究对象,通过基因组和转录组测序研究其与抗氧胁迫适应相关的关键功能基因.基因组测序表明,该菌株基因组全长4176861bp,包含一个rRNA操纵子和161个tRNA基因,共预测到3703个开放阅读框(ORF).利用Blast2GO软件对所预测ORF进行GO分析,并从分子功能、生物学途径和细胞组分三个方面对预测基因进
【机 构】
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国家海洋局 第一海洋研究所,山东青岛266061
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以北极海冰细菌Pseudoalteromonas issachenkonii A2为研究对象,通过基因组和转录组测序研究其与抗氧胁迫适应相关的关键功能基因.基因组测序表明,该菌株基因组全长4176861bp,包含一个rRNA操纵子和161个tRNA基因,共预测到3703个开放阅读框(ORF).利用Blast2GO软件对所预测ORF进行GO分析,并从分子功能、生物学途径和细胞组分三个方面对预测基因进行了聚类分析.结果表明,所预测ORF中有15个与抗氧化活性的分子功能有关.利用RNA-seq技术分别对氧胁迫(培养基中添加1.0 mmol/L H2O2)和对照组(培养基中未添加H2O2)两种条件下Pseudoalteromonas issachenkonii A2的转录组进行了测序.
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