【摘 要】
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橡胶树白粉病是由粉孢属的橡胶粉孢(Oidium heveae B.A.Steinmann)侵染引起的病害,该病菌广泛分布于全球各橡胶种植区,也是我国植胶区早春防治"两病一虫"的重点。橡胶树白粉
【机 构】
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海南热带生物资源可持续利用重点实验室; 海南大学环境与植物保护学院;
【基金项目】
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中国国家重点基础研究计划(2011CB111612);国家农业产业技术体系建设专项(CARS-34-GW8);教育部博士基金(20104601110004);海南大学科研启动资金(kyqd1006)
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橡胶树白粉病是由粉孢属的橡胶粉孢(Oidium heveae B.A.Steinmann)侵染引起的病害,该病菌广泛分布于全球各橡胶种植区,也是我国植胶区早春防治"两病一虫"的重点。橡胶树白粉菌是专性寄生菌,无法在人工培养基离体培养,难遗传操作,病原菌致病机理缺乏详尽研究。本实验室采用Illumina和Miseq平台对O.heveae进行全基因组测序,通过从头预测组装得到8682个编码蛋白的基因。以O.heveae基因编码蛋白序列为材料,结合已报道的白粉菌效应分子特征,对O.heveae候选效应分子进行预测。首先利用SignaIP、TMHMM工具筛选8682个蛋白序列中具有N-端信号肽及信号肽剪切位点后无跨膜结构域的蛋白,共筛选到339个候选蛋白。进一步使用Protcomp、big-PI Predictor和TargetP程序分别预测候选分泌蛋白的细胞定位和锚定位点,并筛选氨基酸残基数量在50~300氨基酸的小分子蛋白,结合blastp程序比对Genbank非冗余蛋白质数据库,找出数据库中那些没有蛋白同源或者同源序列来自白粉菌的序列,最终预测到141个候选的泌出性效应分子,而大多数都是功能未知的假定蛋白。经过与大麦白粉菌效应蛋白同源比对,发现二者保守的效应蛋白不到10个;邻近法系统发育分析显示,O.heveae候选效应蛋白序列差异较大,无明显聚类现象,说明效应分子在病原菌与植物竞争进化过程中受到较大选择压力,进化速率较快。本研究通过生物信息流程预测橡胶树白粉菌的候选泌出效应蛋白,为进一步研究O.heveae的分子致病机理奠定了基础。
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