梨SSR遗传图谱的构建及部分农艺性状的QTL定位分析

来源 :新疆农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:snmn777
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梨(Pyrus L.)是我国栽培史最为悠久的主栽果树之一,栽培面积和产量连续多年位居世界首位。近年来,通过传统育种方法在培育优良品种方面取得很大进展,但在遗传图谱构建及其应用等方面的研究相对落后。本研究以西洋梨品种‘红茄梨’(Red Clapp Favorite)为母本,以东方梨品种‘晚秀梨’(Mansoo)为父本杂交的165株真F1后代单株为作图群体,利用SSR标记技术分别构建双亲的遗传图谱,同时对双亲图谱进行比较分析和整合。此外,根据调查的群体后代生长性状和部分已结果植株的果实性状数据,结合已构建的遗传图谱,利用区间作图法对相关性状进行QTL定位分析,以期为今后相关性状的基因定位及分子标记辅助育种奠定基础。主要结果如下:(1)利用SSR分子标记技术对‘红茄梨’ב晚秀梨’的167株F1代植株进行杂种鉴定,从群体中剔除2株非双亲的真杂种单株,为构建高质量的遗传图谱奠定了可靠的基础,也为后期试验提供真实的材料。(2)利用PCR技术对不同来源的909对SSR引物(526对梨和283对苹果公开发表的SSR引物,梨转录组开发的100对SSR引物)进行初步筛选,在亲本间有效扩增比例在79.54%,多态性比例在60.84%,其中符合作图要求的SSR引物占22.77%。(3)对筛选出符合作图要求的SSR引物在群体中验证,利用JoinMap4.0软件构建双亲的连锁图谱:‘红茄梨’图谱中141个标记位点分布在17个连锁群上,总长度757.34 cM,标记间平均5.37cM,连锁群长度在18.80 cM-63.29 cM,每个连锁群上有4-16个标记;‘晚秀梨’图谱中153个标记位点分布在19个连锁群上,总长度1149.43 cM,标记间平均7.51 cM,连锁群长度在5.67 cM-119.41cM,每个连锁群上有3-17个标记。(4)结合所构建的双亲遗传图谱,利用MapQTL5.0软件,采用区间作图法对树干粗、叶片长度、叶片宽度、叶形指数和叶柄长度5个性状进行QTL定位分析,每个性状在双亲的图谱中检测到2-7个QTL位点,共检测到21个QTL位点。(5)利用筛选出的207对符合作图要求的SSR引物,对F1群体中已结果的81株植株重新构建遗传图谱:图谱中187个SSR标记位点分布在18个连锁群,覆盖基因组964.82 cM,标记间平均5.16cM,每个连锁群上有5-18个标记。(6)结合所构建的已结果植株连锁图谱,利用MapQTL5.0软件,采用区间作图法对梨果实的单果重、横径、纵径、果柄长度及果心大小5个性状进行QTL定位分析,最终检测到与果实的单果重、横径和纵径3个性状相关的4个QTL位点,其中果柄长度和果心大小未检测到QTL位点。
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