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甜瓜(Cucumis melo L.)是一个世界范围广泛种植的园艺作物,多样性较高,许多农艺性状如株型性状、抗白粉病、耐裂果性状对甜瓜的生产十分重要。深入挖掘、利用甜瓜重要性状遗传变异对改良甜瓜品种,促进甜瓜产业化发展至关重要。本研究以甜瓜为实验材料,开展甜瓜农艺性状的遗传分析。并利用简化基因组测序与SNP (Single nucleotide polymorphisms)分型技术,对甜瓜株型性状、抗白粉病性状等重要农艺性状进行全基因组关联分析(Genome-wide association studies, GWAS),为甜瓜育种与后续研究提供借鉴。主要研究内容与结果如下：1.以哈密瓜‘AM-5’为母本,网纹甜瓜‘RE-19’为父本,构建P1、P2、Fl和F2四世代遗传群体,对甜瓜节间长、侧枝长、主茎直径、叶面积和果皮颜色进行遗传分析,发现甜瓜果皮颜色为质量性状,受单基因控制,其它性状为数量性状,受多基因控制。采用主基因+多基因遗传模型对4个数量性状进行分析发现：节间长和侧枝长遗传符合两对加性-显性主基因+加性-显性多基因模型,主茎直径遗传符合两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因混合遗传模型,叶面积遗传符合加性-显性-上位性多基因遗传模型。2.以’AM-5’×’RE-19’群体的双亲和147株F2单株为材料,利用RAD-seq (Restriction Association Site DNA Sequencing)技术进行SNP开发与分型,对五个性状进行全基因组关联分析。发现节间长相关联的SNP位于1号、10号染色体；侧枝长相关联的SNP分布于1、4和8号染色体上；叶面积相关联的SNP分布于1、3、4、8、11和12号染色体。在1号染色体上的16265415 bp-31301063b区域检测到的SNP,与节间长、侧枝长和叶面积性状值关联都达到了显著性。与果皮颜色相关联显著的SNP的区域位于10号染色体,该染色体的3453384bp-5647302bp区域检测到的SNP都达到了显著性。3.以网纹甜瓜‘RE-33’为母本,多年自交系‘MOIN-10’为父本配制6世代联合遗传群体(P1、P2、F1、B1、B2、F2),对甜瓜耐裂果性状、抗白粉病性状进行遗传分析,发现甜瓜抗白粉病性状为质量性状,受单基因显性控制。甜瓜耐裂果性状为数量性状,受多基因控制。采用主基因+多基因遗传模型对甜瓜耐裂果性状进行遗传分析,发现甜瓜耐裂果性状符合E-0模型,即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因遗传模型。主基因在B1、B2和F2群体中的遗传力分别是46.24%,59.19%和57.98%,多基因的遗传力分别是21.26%,2.02%和9.74%。同时,B1、B2和F2群体中遗传变异分别占其表型变异的67.51%,61.19%and 67.73%。说明甜瓜耐裂果是由遗传因子控制的,并受到环境的影响。在甜瓜耐裂果育种中,应在早代进行选择。4.以’RE-33’×’MOIN-10’群体的F2代构建感、抗白粉病混池,利用2b-RAD (Type ⅡB restriction site Associated DNA sequencing)技术对两个混池进行SNP分型。通过全基因组关联分析,将甜瓜‘RE-33’内抗白粉病基因定位在甜瓜基因组2号染色体135976bp-1418829bp的位置。