蜱隶属于节肢动物门（Arthropoda）、蛛形纲（Arachnida）、蜱螨亚纲（Acari）、寄螨总目（Parasitiformes）、蜱目（Ixodoida）,是一类以吸血为生的体外寄生虫,同时也是多种病原体的传播媒介。蜱虫呈世界性分布,严重影响人类和动物的健康。目前,蜱及蜱传病已经成为全球非常严重的公共卫生问题。因此,对蜱虫进行准确的分类鉴定是从事蜱虫病及蜱传病研究的基础和前提。蜱虫的传统分类主要依据蜱类的形态学特征、宿主种类和地理来源等,然而对于那些相近种或者近缘种通常具有相似的形态特征,常常无法对其进行准确的区分。随着分子生物学及其技术的发展,以基因序列作为分子标记能解决这一问题。线粒体基因组具有母系遗传,结构简单,进化速度快等特点,已广泛应用于多类寄生虫的分类学和系统发育学等研究。本研究通过高通量测序和生物信息学方法获得了六种硬蜱（日本硬蜱Ixodes nipponensis、壤塘硬蜱Ixodes rangtangensis、爪哇花蜱Amblyomma javanense、亚洲璃眼蜱Hyalomma asiaticum、血红扇头蜱Rhipicephalus sanguineus和草原血蜱Haemaphysalis verticalis）的线粒体基因组序列,并结合NCBI公布的相关蜱虫线粒体基因序列构建系统发育树,从而探讨硬蜱科的系统发育关系。主要研究结果如下:（1）日本硬蜱（I.nipponensis）线粒体基因组序列全长为14,505 bp,壤塘硬蜱（I.rangtangensis）线粒体基因组序列全长为14,543 bp,爪哇花蜱（A.javanense）线粒体基因组序列全长为14,780 bp,亚洲璃眼蜱（H.asiaticum）线粒体基因组序列全长为14,722 bp,血红扇头蜱（R.sanguineus）线粒体基因组序列全长为14,715 bp,草原血蜱（H.verticalis）线粒体基因组序列全长为14,855 bp。六种硬蜱线粒体基因组均包含37个基因,其中13个蛋白质编码基因,2个r RNA基因和22个t RNA基因。除日本硬蜱和壤塘硬蜱仅有一个非编码区外,其余四种硬蜱均包含两个非编码区。六种硬蜱线粒体基因呈现2种不同的排序方式:日本硬蜱和壤塘硬蜱线粒体基因排列顺序一致,其余四种硬蜱基因排列顺序一致。六种硬蜱均具有明显的AT碱基偏向性,除壤塘硬蜱AT含量为72.8%外,其余五种硬蜱AT含量均在77%-80%之间。（2）六种硬蜱的线粒体蛋白质编码基因的起始密码子除了使用标准的ATG、ATT和ATA外,在爪哇花蜱中还使用了一种不常见的起始密码子（atp8基因使用ATC作为起始密码子）。六种硬蜱的线粒体蛋白质编码基因的终止密码子除了使用TAG和TAA作为终止密码子,还均使用了不完整密码子TA或T作为转录终止信号。六种硬蜱的t RNA基因排列十分紧密,每种硬蜱都存在t RNA基因碱基的重叠。日本硬蜱的rrn L和rrn S基因A+T含量一致,均为79%,壤塘硬蜱均为76%,但是其他四种硬蜱的rrn L的A+T含量均高于rrn S。（3）基于40种硬蜱的线粒体13个蛋白质编码基因氨基酸序列,利用最大简约法（MP）、最大似然法（ML）和贝叶斯法（BI）构建的系统发育树均显示:花蜱分布在两个分支,指示花蜱属为多系;而硬蜱属、血蜱属、璃眼蜱属、扇头蜱属、凹沟蜱属和革蜱属均为单系群。本研究对六种硬蜱进行了线粒体全基因组的解析和系统发育分析,本研究结果不仅填补了硬蜱科一些重要物种的线粒体基因组的空白,而且将为硬蜱的分子鉴定、分子分类学和分子系统发育学等研究提供重要理论依据。