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目的:
1、检测线粒体DNAcomplexⅣ突变在甲状腺患者中的发生情况。
2、研究分析线粒体DNAcomplexⅣ与甲状腺肿瘤临床资料之间的关系。
3、探讨线粒体DNAcomplexⅣ突变在甲状腺肿瘤发生发展中的作用。
方法:
1、标本的收集:随机收集温州地区甲状腺肿瘤患者的冰冻病理切片,及其外周静脉血,同时收集其临床资料。选取60例甲状腺恶性肿瘤(甲状腺乳头状癌59例和甲状腺滤泡状癌1例)和20例甲状腺良性肿瘤(腺瘤型结节性甲状腺肿1例和甲状腺腺瘤19例)进行实验。
2、全基因组DNA的提取:光学显微镜下观察病理冰冻组织切片,区分肿瘤组织和肿瘤旁正常组织,分别刮取肿瘤组织和肿瘤旁正常组织。用试剂盒法提取血液标本的全基因组DNA,按酚-氯仿法提取肿瘤组织和肿瘤旁组织的全基因组DNA。
3、PCR扩增:设计7对互相交叉的引物对线粒体DNAcomplexⅣ进行PCR扩增,PCR产物直接进行测序。
4、数据分析:以患者自身的外周静脉血序列为对照,应用软件CodoncodeAligner对测序结果进行线粒体DNAcomplexⅣ突变情况分析。进一步分析氨基酸改变并运用生物软件进行保守性分析,借助蛋白质数据库对二级结构进行预测,探讨complexv突变致瘤的分子机制。
5、统计分析:结合患者的临床资料,通过统计学方法分析来探讨线粒体DNAcomplexⅣ突变与患者的临床病理资料之间的关系。
结果:
1、本研究在mtDNAcomplexⅣ亚基上共检测到5个突变,其中2个为同质性突变(40%),3个为异质性突变(60%)。其中观察到3个突变位点G6321A、G6789A和A7718G从血液到肿瘤组织的异质性变化,即由野生型向突变型的转变过程。
2、本研究样本例数和地域范围内,在60例甲状腺恶性肿瘤患者中的5例(8.33%)检测到突变;在20例甲状腺良性肿瘤患者中的0例(0%)患者检测到突变。对其进行统计学分析,结果p值>0.05,认为两组间突变率无统计学差异。
3、5个突变位点中,3个为无义突变(包括G6321A、G6708A和G6789A),2个为错义突变。2个错义突变均引起氨基酸极性改变,对其二级结构进行预测,没有引起跨膜螺旋的改变。无义突变引起了其编码多肽链的缩短,二级结果预测的结果显示跨膜螺旋的数目减少。
4、本研究突变位点在complexⅣ上的分布情况为COX1基因4个、COX2基因1个,而碱基改变5个均为G-A。
5、本研究在complexⅣ上共发现65个多态性位点,其中有11个是未报道的。其中64个位点(98.46%)为碱基之间的转换,2个(3.03%)为碱基之间的颠换(包括1个C-A,1个T-A)。
6、对mtDNAcomplexⅣ突变与甲状腺肿瘤患者临床资料进行相关性分析,结果发现甲状腺恶性肿瘤患者中complexⅣ突变更容易发生在年轻患者(P值为0.036)以及男性患者中(P值为0.03)。
结论:
1、观察到3个突变位点(G6321A、G6789A和A7718G)从血液到肿瘤旁组织,再到肿瘤组织的异质性变化,即由野生型向突变型的转变过程。
2、在本研究样本例数(包括60例恶性和20例良性甲状腺肿瘤)和地域(温州地区)范围内,mtDNAcomplexⅣ突变在恶性肿瘤组高于良性肿瘤组,突变率无统计学差异(p值>0.05),但无义突变G6321A、G6708A和G6789A的二级结构预测结果显示蛋白质二级结构发生改变,推测其可能在甲状腺肿瘤的发生发展中起一定作用。
3、本研究范围内mtDNAcomplexⅣ突变与甲状腺恶性肿瘤患者的性别、年龄相关。mtDNAcomplexⅣ突变更容易发生在年轻患者以及男性患者中。