要了解新疆的历史,就应当了解新疆历史上各个时期的宗教的发展状况及其对当时社会各个方面的影响。叶尔羌汗朝是新疆历史发展中的一个重要的时期。这一时期,伊斯兰教的的思想和制度已渗透到社会各个领域。本论文论述和分析了叶尔羌汗朝时期伊斯兰教的发展对汗朝社会制度、政教关系和文化的影响。同时对苏非派对叶尔羌汗朝宗教生活影响也作了系统地分析和论述。这一时期的社会制度受到伊斯兰教的影响,伊斯兰教的影响在政治制度上的影响体现在汗朝的统治制度和官制上,叶尔羌汗朝始终是一个封建世俗王朝,汗朝统治者是世俗的蒙古察合台系后裔并不是宗教首领。在官制方面出现了伯克制的雏形,有由政府任命或认可的伊斯兰教官职。在经济制度方面,叶尔羌汗朝时期形成了带有伊斯兰印记的封建经济制度,其中土地制度和赋税制度受伊斯兰教的影响最为明显。和卓占有大量的宗教瓦合甫土地,这时期的赋税制度是按照伊斯兰法律,国家向农民征收“什一税”,对于瓦合甫土地和赏赐土地,政府免于征税。这些经济制度使得和卓势力经济实力的增长,为和卓势力的发展提供了物质基础。伊斯兰教的发展往往借助于统治政权的扶持,而统治政权的争夺和巩固又受到宗教势力的影响甚至是操控。在叶尔羌汗朝的不同时期,随着伊斯兰教的发展,政教关系也随之演变,叶尔羌汗朝的初期,宗教活动受世俗统治者的制约,宗教上层的地位并不高,在这一时期世俗统治者利用宗教作为维护其统治的工具。到叶尔羌汗朝后期,和卓势力为代表的宗教上层势力逐渐发展,对汗朝的影响力增强。最后黑山派、白山派的斗争最终将叶尔羌汗朝断送于准噶尔汗国的铁骑之下。叶尔羌汗朝时期,苏非派对宗教生活的影响有两个明显的标志-和卓崇拜和麻扎朝拜的高潮,这也是这一时期伊斯兰教发展的突出特点。这一时期的和卓崇拜的特点是信徒人数的剧增,上至王公贵族,下至百姓都表现出对和卓的赞美和绝对的服从。苏非派和卓势力的发展和兴起带来了麻扎朝拜的高潮,和卓们利用麻扎朝拜吹捧和神话自己,麻扎还成为和卓、依禅争权夺利的重要工具。随着麻扎的被神化,麻扎朝拜逐渐成为穆斯林宗教生活的仪式之一。叶尔羌汗朝时期,是维吾尔族文化发展的—个重要阶段,维吾尔族在政治、宗教、文字等方面实现了统一。伊斯兰教的广泛传播及其对察合台后裔所建立的蒙古王朝朝野上下产生的重大影响和其在维吾尔族统治地位的确立,使这一时期各种文化艺术表现形式都程度不同受到伊斯兰文化的影响。