寡营养菌是指能够在低浓度营养素甚至没有营养素的条件下生长的微生物。绝大部分真菌的生长需要有机碳源丰富的培养基，然而少数真菌可以在没有添加碳源的硅胶培养基，甚至没有任何碳源的水中生长。研究寡养真菌的多样性，生理生化及代谢产物对工农业和医学等领域都有重要意义。本研究的内容包括两方面，首先是利用无碳源的硅胶培养基大量收集筛选寡营养菌株，结合形态学和系统发育学，对洞穴中寡营养真菌的物种多样性及分类学进行研究。其次探究寡营养环境下真菌生长的生理特征，特别是对无机碳源的利用以及固定CO2的机制。　　从洞穴的土壤、碳酸岩、空气及水体等低营养生境中，利用不含碳源的硅胶培养基初步分离得到寡营养真菌菌株169株，ITS序列比对初步鉴定属于50个属，83个种，其中75个种是此前研究中从未报道过的寡营养真菌，36种为潜在新种或新属。综合分子系统学数据和形态学观察结果，本文描述新种5个，分别是:Allophoma oligotrophica、Cephalotrichum guizhouene、C.oligotrophium、C.laeve和Paraboeremia oligotrophica。《国际藻类、真菌及植物命名法则》认可的真菌物种描述语言为英语或拉丁语，本文使用英文进行真菌形态描述。分析还表明寡营养真菌为多起源，83个种分布于50个属，30个科，11个目，4个纲中。上述结果表明，自然环境中广泛存在着能在低营养条件下生长的真菌，物种多样性较高。此外，选取在燕麦培养基(OA)上生长较快且产生分生孢子较多的Cephalotrichum oligotriphicum(CGMCC3.18328)为供试菌株，利用寡营养液体培养基进行发酵培养并测定其生物量，结果进一步证明该寡营养真菌可以在有机碳源（葡萄糖）C浓度低于10mg/L的条件下生长，并且也能在无机碳源(NaHCO3)C浓度低于10mg/L的条件下生长，实现生物量增加。进一步通过测定液体培养基中总碳含量和同位素比质谱实验验证该菌株对无机碳源(NaHCO3)的吸收利用，结果显示供试菌株可以吸收无机碳源，并且在无机盐提供基本生长元素条件下，能够促进该寡营养真菌对NaHCO3的吸收。