不同品种(系)猪肥胖基因(ob)部分序列的PCR-SSCP多态性分析

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肥胖基因(ob)由3个外显子和2个内含子组成,ob基因产物—leptin是调节体内脂肪含量和体重的重要信号因子,其有可能是影响猪生长和脂肪沉积的数量性状位点,所以对它的分析将在猪的育种中有重要理论意义和实际意义。 本研究利用PCR-SSCP(PCR-Single Stand Conformation Polymorphism)技术,以大白猪,双肌臀大白猪、长白猪、杜洛克、民猪、三江白猪、野家杂种猪、野猪8个不同的猪品种(系)为研究对象,根据Genebank上猪ob基因序列设计了3对引物,对猪ob基因的第1、2外显子进行PCR扩增,PAGE凝胶电泳,并对有多态性的纯合片段进行克隆测序。基因型检测结果为:民猪均为BB型,双肌臀大白猪均为AA型,其他6个品种均有AA、BB、AB 3种类型;A基因在ob基因第3469bp,即第2外显子的69碱基处发生一个点突变:T→C,该突变属于沉默突变。 经试验统计和计算各基因型频率和基因频率表明:民猪、三江白猪、杜洛克、大白猪、长白猪、双肌臀大白猪、野猪和野家杂种猪的A基因频率除野猪、野家杂种猪外呈现依次上升趋势,即0.000→0.577→0.738→0.798→0.809→1.000,而品种瘦肉率也完全按此顺序呈上升趋势;民猪是进行肥猪育种所形成的品种,其A基因频率下降,所检测40个个体中A基因频率达到0,三江白猪、杜洛克、大白猪、长白猪是以追求高瘦肉率为重要的育种目标之一,经长期选育而形成的品种,A基因频率呈现升高趋势,并随品种瘦肉率增加而升高,野猪和野家杂种猪的A基因频率基本在进行肥猪育种和瘦肉猪育种的品种中间,双肌臀大白猪A基因频率为1。本研究得出趋势性结论:A基因频率一方面与瘦肉率呈正相关、与双肌臀性状相关,一方面与育种选择方向有关。所以在猪育种中可以把ob基因的A基因作为高瘦肉率的选择标记。 利用PCR-SSCP技术检测ob基因的基因型,使试验操作简单,灵敏度提高,可以在标记辅助育种研究中广泛应用。
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