经颅磁刺激(transcranial magnetic stimulation,TMS)作为一种非侵入性脑刺激技术(noninvasive brain stimulation)应用于临床已有三十多年的历史,因为对神经可塑性的调节作用,使其作为脑卒中运动功能障碍,语言障碍,注意力障碍-患侧忽略等常见后遗症的辅助治疗,但是从上世纪90年代应用于临床康复方案的制定后,其对卒中后遗症的功能改善效果存在许多争议和质疑。近年来,随着神经成像技术,特别是功能核磁共振的发展使我们对卒中后大尺度水平(large scale level)的功能重组过程有了更深的了解,其中涉及系统神经网络范围中连接状态的改变,伴随着网络连接的异常与功能障碍之间相关性的阐明,进一步地,通过对这些病理的连接状态的调节可以得到功能障碍的改善,而TMS作为一种有效网络连接调节工具再次受到研究的关注。目前越来越多的研究发现,在神经网络框架下,经颅磁刺激参与到卒中后异常网络模式内连接状态的调节,可得到功能改善的效果,这种效果相比于目前临床应用TMS卒中后康复方案仅作用于异常神经兴奋性的调节,有了更加完善系统的理论依据和实验数据支持。在神经网络理论和网络连接分析的指导下,使经颅磁刺激的治疗作用前景大大提升,尤其在改善高级认知活动障碍方面也取得了前所未有的成果。本文通过检索文献,评价总结现有临床TMS治疗方案对卒中后功能障碍的治疗效果,在此基础上,结合神经网络理论和功能核磁共振影像数据连接分析,介绍TMS的卒中功能障碍治疗方面取得进展,希望对TMS临床治疗方案更有效的制定提供一定帮助。