京海黄鸡E-FABP基因多态性与相关性状的关系

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脂肪酸结合蛋白(FABPs)是一族同源性较高的小分子量(14-15 kDa)的细胞溶质蛋白,它被认为参与了长链不饱和脂肪酸的新陈代谢。表皮型脂肪酸结合蛋白(E-FABP)作为FABPs家族的一员,又被称为牛皮癣相关蛋白(PA-FABP)、角质化细胞蛋白或DA11,它是首次被确认的牛皮癣相关蛋白,它在牛皮癣的表皮中,在不同的癌物质中高度表达,并且它被证实能促进新陈代谢的形成。本研究采用PCR-SSCP和测序的方法检测了京海黄鸡E-FABP不同的基因片断的多态性,对单核苷酸多态性进行了群体遗传学分析。同时进行了基因多态位点与相关性状的关联分析。结果如下:1.京海黄鸡E-FABP基因引物P1( P99)的PCR扩增产物结果中检测到AA、CC、AB、AC、BC五种基因型,其中A等位基因频率为0.4468,B等位基因频率为0.0993,C等位基因频率为0.4539; P95(P98)的PCR扩增产物结果中检测到DD、DE、EE三种基因型,其中D等位基因频率为0.6099,E等位基因频率为0.3901。卡方检验表明在这两个基因位点上基因频率和基因型频率都达到了Hardy-Weinberg平衡状态。P74的PCR扩增产物中检测到Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ三个基因型,基因型频率分别为0.7092、0.0851、0.2057。2.测序结果表明引物P74的基因编码序列在E-FABP基因第2187bp处发生了G→A突变,第2268bp处发生了T→C突变,第2273bp处发生了T→A突变,第2342处发生了T→C突变;引物P95和P98的基因编码序列在E-FABP基因的第4015bp处发生了A→G突变;引物P1和P99的基因编码序列在E-FABP基因的第4269-4288bp处有CTTAAATTTTCCTTACATTC 20个碱基缺失。3. E-FABP引物P1( P99)突变位点基因型对京海黄鸡胫围有极显著影响(P<0.01),对肌胃重有显著的影响(P<0.05)。京海黄鸡公母鸡中AA基因型胫围最大,BC基因型胫围最小,AB基因型肌胃重最大。4. E-FABP引物P95(P98)突变位点基因型对京海黄鸡的体重、体尺及屠宰性状有着显著的影响。总体来看,DE基因型在很多性状上优于DD和EE基因型,EE基因型最差。5. E-FABP引物P74突变位点基因型对京海黄鸡的腹脂重及胸肌率有一定的影响,但不显著;对胸肌重、脾脏重有显著的影响(P<0.05);对腹脂率有极显著的影响(P<0.01);在胸肌重、胸肌率、脾重等性状上,Ⅲ型都要优于Ⅰ型和Ⅱ型,母鸡的腹脂重和腹脂率Ⅱ型显著高于Ⅰ型(P<0.05),并且也高于Ⅲ型,但差异不显著。综合分析结果,E-FABP基因P1(P99)和P95(P98)多态位点对鸡的生长性状及生产性能有重要的影响,可以尝试将其作为生长性状及生产性能的分子标记用于鸡的标记辅助选择。
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