丝氨酸二肽侧链与不同种类分子形成氢键的理论研究

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氢键在化学、生命科学和功能材料等领域起到至关重要的作用,对其能量以及结构的分析非常重要。本文运用MP2方法,计算不同小分子与丝氨酸二肽侧链形成氢键的二聚体结构、能量以及势能曲线。主要工作可以归纳如下方面:1.主要研究四种氢键类型:C=O…H-O、O…H-O、S…H-O以及N…H-O。通过计算发现,N…H-O型氢键能量最稳定;当受体分子中O原子两侧基团相同时,sp3杂化的O原子形成氢键比sp2杂化的O原子形成氢键更稳定。2.对于C=O…H-O型氢键,小分子作为质子受体,羰基上的基团为供电子基团时,羰基的键长伸长,质子供体上羟基的键长伸长;当取代基为吸电子基团时,羰基的键长缩短,质子供体上羟基的键长缩短。对于O…H-O和S…H-O型氢键,小分子作为质子受体,当O(S)原子上连接供电子基团时,质子供体上羟基的键长伸长;当O(S)原子上连接吸电子基团时,质子供体上羟基的键长缩短。3.采取Sun的参数对14种二聚体运用氢键势能函数计算势能曲线,与基组重迭误差计算得到的曲线相比较:对C=O…H-O型氢键势能曲线描述的比较好。
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