肠道菌群对动物维持机体的健康极为重要,在调节宿主代谢、免疫、生长发育等功能方面发挥重要的作用,所以肠道微生物群落一直是微生物的研究热点。肠道微生物群落的菌群随着动物的进化而不断进化,从而有助于动物的整体发育和代谢需要。细菌在肠道的植入是一个复杂的生态演替过程,其中微生物区系的组成不断变化。猪的肠道微生物群一直是许多研究的主题,不同生长阶段的肠道微生物群落组成不同,且随寄主年龄的变化而变化。本研究采用16S r DNA基因文库技术和Illumina Mi Seq测序技术分析了不同月龄的六白猪的肠道微生物群落组成及其多样性,而后通过对六白猪肠道菌群的纵向调查研究,以期为进一步探讨六白猪肠道微生物的功能提供理论支持。其次,在本次研究中,还分析了六白猪与大白猪肠道微生物群落组成及多样性的差异。主要研究结果如下:不同月龄的六白猪肠道菌群在门分类水平上相对丰度占前五位的均为拟杆菌门、厚壁菌门、螺旋体门、变形菌门、软壁菌门,占肠道菌群的95%以上,肠道菌群丰度最高的均为拟杆菌门,并随着月龄的变化逐步降低;在属水平上,不同月龄的六白猪肠道菌群在门分类水平上相对丰度占前五位的为普雷沃菌属、密螺旋体属、乳杆菌属、CF231、厌氧弧菌属,不同月龄丰度最高的均为普雷沃菌属。由此可以看出,不同月龄的六白猪肠道微生物群落比较相似。虽然不同月龄六白猪的肠道微生物优势菌门以及优势菌属相同。但是他们在这些菌群的丰度上存在差异。普雷沃菌属、厌氧弧菌属、琥珀酸弧菌属随着月龄的增加有下降的趋势,CF231的相对丰度随月龄的增加有上升的趋势。除此之外,未分类菌群在所检测的所有月龄的肠道微生物群落中占有较高的比例。六白猪与大白猪的肠道微生物群落的Alpha多样性没有显著差异。在门水平上,六白猪与大白猪的优势菌群有所差异。六白猪的肠道的六白猪的优势菌门为拟杆菌门,次优势菌门为厚壁菌门。而大白猪的肠道菌群优势菌门为厚壁菌门,次优势菌门为拟杆菌门。在属水平上,六白猪与大白猪的微生物群落结构与丰度都有所差异。六白猪的肠道微生物群落在属水平上的优势菌属分别为:普雷沃菌属,CF231、颤螺菌属,瘤胃球菌属,考拉杆菌属。大白猪中相对丰度在前五位的(从高到低)肠道菌群分别为:普雷沃菌属,乳酸杆菌属,颤螺菌属,梭菌属,SMB53。PLSDA分析表明,三个代谢通路在两组之间表现出显著差异。六白猪在神经系统代谢通路、免疫系统、蛋白质代谢通路相关微生物菌群的丰度明显高于大白猪。