以木薯为原料的酒精生产存在发酵产酸高，影响原料转化率的问题。通过对多种淀粉质原料携带微生物数量及发酵性质的研究，发现木薯原料携带的微生物数量比玉米多103倍。对比发现，木薯原料由于营养贫乏、缺乏氮源，导致发酵液易产酸。以尿素为氮源时，发酵过程产酸低，最终发酵液酒精度高，尿素的最适添加量为0.3％(w/v)。　　 将酒精发酵与一级高温厌氧沼气发酵进行耦联。即，酒精废液冷却至60℃后直接进入厌氧反应器，经厌氧处理后酒精废液COD降低，再将厌氧出水全部循环用作酒精发酵工艺配料水。结果表明，一级高温厌氧沼液中含有酒精发酵的抑制性物质，虽然发酵液中酒精终浓度不受影响，但发酵时间随着循环的进行不断延长。进一步研究发现，厌氧消化液对酒精发酵起主要抑制作用的是乙酸、乳酸、丙酸等小分子有机酸，它们对酒精发酵产生抑制的浓度分别为0.2％(w/v)、2.5％(w/v)、0.1％(w/v)。　　 酒精废液经过一级高温厌氧处理后的COD在10，000 mg/L左右，厌氧出水的COD和小分子有机酸含量较高。因此，将一级高温厌氧出水再经过第二级中温厌氧处理，两级厌氧出水的COD降2000 mg/L左右，小分子有机酸含量低于抑制浓度。实验证明，两级厌氧出水适合酒精发酵。循环至此已稳定运行20批，两级沼气发酵与酒精发酵耦联体系至第5批时即达到平衡，并且未发现任何对酒精发酵抑制的现象。酒精发酵料水比1:3，发酵时间控制在48 h左右，发酵液酒精度在10.5％上下波动，平均淀粉利用率达92％。