南大西洋沉积环境可培养放线菌多样性研究及多相分类鉴定

来源 :国家海洋局第三海洋研究所 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zl9881123
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放线菌作为非常重要的生物活性物质的来源,一直以来受到大家的广泛关注。随着陆地放线菌的深入研究,陆生放线菌中发现新菌种、新抗生素的机率大大降低,海洋放线菌资源的开发与利用日益成为焦点。本研究从南大西洋14个沉积物样品中共获得321株可培养放线菌菌株,分属于放线菌亚纲下的7个目的16个科中的24个属,其中Dietzia(20.56%)、Brachybacterium(14.33%)、Microbacterium(13.08%)、Kocuria(11.53%)、Streptomyces(10.28%)为优势属。与模式菌株16S rRNA基因序列最高相似性在97%以下的菌株有4株,与模式菌株16S rRNA基因序列最高相似性为97%-98%的菌株有11株,与模式菌株16S rRNA基因序列最高相似性为98%-98.5%的菌株有3株,这18株均为潜在新分类单元。本文测试了所用分离培养基及预处理方法的效果,对部分代表菌株进行了PKSⅠ、PKSⅡ及NRPS功能基因的筛选及抗性试验。结果表明差速离心法(DDC法)是较好的预处理方法,腐植酸-维生素(HV)培养基是分离效果较好的培养基。34株化合物合成基因检测菌中PKSⅠ基因、PKSⅡ基因呈阳性的比率均为17.64%,NRPS基因呈阳性的则为52.94%。抗枯草芽孢杆菌和抗副溶血性弧菌的菌株分别有47.06%和7.82%。南大西洋蕴含着丰富的放线菌资源,不仅数量可观而且含有不少潜在新分类单元,如提高采样技术,改进现有分离手段,并建立新的分离方法,应可获取更多新的放线菌菌种资源。运用基于表型、化学分类学及基因型特征的多相分类方法,对3株涅斯捷连科氏菌属潜在新种及1株短状杆菌属潜在新种进行了形态学、生理生化特性及分子分类的鉴定,基本确定了这四株放线菌的分类地位,同时对其进行了菌种描述。
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