细胞周期蛋白生物信息学分析

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细胞周期蛋白是细胞分裂中重要的调控因子之一,在细胞周期中,周期蛋白结合并激活CDK活性,发挥对细胞周期的调控作用。前人研究表明周期蛋白在分子结构上有一段保守的250个左右氨基酸残基的cyclin core结构域, cyclin core包含2个结构域:cyclin_N(N端cyclin box)和cyclin_C(C端cyclin box)。本实验以GeneBank为数据库,选取了其中10个模式物种的365条周期蛋白序列作为基础数据,并按它们的结构域特点进行分类。重点分析了完整双域和完整单一cyclin box域这两种情况,然后对构建出的系统发育树中一些特殊周期蛋白进行了分析,从而总结出如下几点主要结论:1、越是高等的生物含有周期蛋白的不论种类和数量都要越多,这也表明了高等生物有着更复杂的细胞周期调控机制。动物的周期蛋白种类要普遍多于植物、真核单细胞生物和原核生物中的,但植物中含有的大多数亚型成员要多于动物中的。2、 cyclin_C(?)吉构域在某些周期蛋白中是一个重要的结构,它对这些周期蛋白在细胞周期所发挥的功能有着很大的联系。3、在真核单细胞周期蛋白序列中,G2/M期的周期蛋白都含有双结构域,而G1/S期的周期蛋白绝大多数都出现在单域中,不含有cyclin_C结构域。4、不同物种间命名不同的周期蛋白可能会在它们各自的细胞周期中发挥相似的作用,如植物cyclin U/P和动物cyclin Y的关系;同种物种内一些周期蛋白可能会取代此物种所缺乏的周期蛋白的作用,如植物中所缺乏的cyclin E可能会被其他周期蛋白填补其功能。5、真核型细胞周期蛋白的进化趋势是增加类型和数量,动物以增加细胞周期蛋白的类型为主,而植物则是以增加细胞周期蛋白类型中的成员为主;另一进化趋势是由单域向双域发展,物种进化程度越高,所具有的双域细胞周期蛋白的类型就越多。
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