组蛋白乙酰化的水平是由组蛋白乙酰转移酶(histone acetyltransferase，HAT)和组蛋白脱乙酰化酶(histone deacetylase，HDAC)共同作用决定的，HDACs通过调节染色质结构在基因的表达调控中起着重要的作用。水稻中总共含有18个HDACs成员，分为3大家族：RPD3/HDA1家族14个成员、SIR2家族2个成员、HD2家族2个成员。为了了解水稻中HDACs的生物学功能，本研究利用生物信息学和分子生物学方法对它们的功能进行了分析，得到如下结果：　　 1.利用生物信息学方法分别对RPD3/HDA1、SIR2和HD2家族成员的结构进行了研究，发现水稻RPD3/HDA1 HDACs蛋白质可分为Class I、Class II、ClassⅢ和Class IV四类，除了HDA707外的所有HDACs均含有保守的结构域、组氨酸残基和半胱氨酸残基，另外Class I HDACs中，除了HDA707外其它成员还有N-糖基化位点(NWS)。SIR2家族和HD2家族中各成员均含有数量不同的蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶II磷酸化位点；多序列比对发现水稻SIR2家族成员sirtuin结构域和HD2家族的nucleoplasmin结构域与玉米及拟南芥中的一样是高度保守的；电子表达谱分析表明水稻中这18个HDACs成员的在器官(组织)的表达模式不同，如SRT701主要表达于叶片和花序，SRT702表达于整个植物中；HDT701表达于整个植物中，HDT702主要表达于花序。　　 2.利用RT-PCR方法检测水稻HDACs基因的表达模式，结果表明：不同的HDACs的空间表达模式不同，如HDA702，HDA704， HDA712， HDT701和SRT701在根、茎、叶中均表达，HDA706和，SRT702在茎和叶中表达，HDA714在叶中表达，HDA705和HDT702在根中表达。此外，JA能诱导HDA705和HDT701的表达；SA和JA能诱导HDT702的表达：ABA降低SRT701和SRT702的表达，抑制HDT701的表达。低温、甘露醇和NaCl都降低SRT701和SRT702的表达，而甘露醇和NaCl增强HDA702的表达。表明水稻中不同的HDACs基因有不同的表达模式，并且可能参与JA、SA和ABA信号的传导和对环境胁迫的应答。　　 3.利用RT-PCR分别克隆了HDA714、SRT701和HDA705 cDNA，并进行了测序分析，成功得到了HDA714和SRT701的全长cDNA及HDA705部分序列(600bp左右)，在此基础上，PCR扩增分别得到了HDA714和SRT701 ORF，为通过转基因技术来研究这些基因的功能打下了基础。另外，还通过PCR方法扩增得到了HDA702的特异序列并进行测序分析，得到了HDA702的目的片段，并成功构建了pMD18T-HDA702重组质粒，为利用RNAi技术研究该基因的功能奠定了基础。　　 4.通过农杆菌介导法将拟南芥AtHDA6/AtHDA19两个基因转入到了水稻日本晴品种的愈伤组织中，经抗生素筛选成功得到了抗性愈伤组织。利用荧光显微镜观察，发现所得到的抗性愈伤组织在蓝光下有强烈的绿色荧光信号出现，目前正在进行分化试验。该研究为通过异源表达进一步验证AtHDA6/AtHDA19的功能打下了基础。