随着社会主义市场经济体制的不断完善，现代社会组织的分化与分工不断细化，事业单位在推动我国经济发展和社会进步中扮演着不可或缺的角色。目前我国事业单位分类推进改革已经进入了关键的时期，且税收政策对事业单位规定存在诸多模糊点。呼市地税局直属征收管理二分局是内蒙古自治区地税系统唯一一家行政事业单位专业化管理分局，承担行政事业单位、社会团体、民间组织等单位税源精细化、专业化管理。多年来，事业单位企业所得税缴纳的混乱和管理的艰难，成为分局税收征管工作的绊脚石。　　本文从分局征管的实际需求出发，采用归纳分析、调查研究及比较分析等方法，通过分析呼市地税局直属征收管理二分局2013年度事业单位企业所得税汇算清缴情况，指出事业单位缴纳企业所得税存在的问题，并分别从事业单位体制上的弊端及企业所得税法的相关内容找出问题的原因所在。从而找到解决事业单位缴纳企业所得税问题的合理方法，并提出了相应的对策建议，以促进事业单位更加合理、规范的缴纳企业所得税。