水稻种子耐低氧萌发是直播水稻种植的一个重要特征,也是解决影响直播稻产量不高不稳及全苗问题的关键,所以耐低氧萌发活力强的种子对于直播栽培均具有重要的意义。本研究以229份水稻染色体单片段代换系(single segment substitution line,SSSLs)为试验材料,在5.1 cm高度淹水低氧胁迫条件下,于30℃/16 h光照/8 h黑暗的培养箱中培养7 d后,以胚芽鞘生长长度为指标定位水稻种子耐低氧萌发相关的QTL(quantitative trait loci,QTL)。主要结果如下:1、本研究以胚芽鞘长度作为低氧萌发表型评价指标,检测了5个季节的材料,2015年早季、2015年晚季、2016年早季、2016年晚季和2017年早季的胚芽鞘的长度范围分别为1.59-3.24 cm、1.49-2.87 cm、1.06-2.87 cm、1.61-3.45 cm和1.05-2.65 cm,胚芽鞘平均长度分别为2.56 cm、2.31 cm、2.30 cm、2.32 cm和2.05 cm,HJX74的胚芽鞘平均长度分别为2.54 cm、2.20 cm、2.28 cm、2.38 cm和2.28 cm。HJX74的胚芽鞘长度范围在2.16-2.56 cm之间,HJX74的胚芽鞘长度大概处于所有SSSLs的中间位置,作为对照材料,有利于对耐低氧萌发(anaerobic germination,AG)QTL的正负效应的分析。2、以胚芽鞘长度为指标,有19个SSSLs至少有两个季节被检测出携带耐低氧萌发QTL,加性效应百分率有正效和负效之分,9个SSSLs表现为正效应,加性效应百分率数值范围为4.3-11.2%;10个SSSLs表现为负效应,其加性效应百分率数值范围为7.2-18.5%。3、本研究的229份SSSLs的代换片段分别来自24份供体亲本,检测到QTL的SSSLs的代换片段分别来自中4188、籽恢100、Katy、苏御糯、IR64、Basmati 370和IRAT 261共7份供体亲本材料,供体来源为籽恢100的SSSLs被检测到QTL的数量最多,在水稻种子耐低氧萌发的研究中或许有重要作用。本研究中检测出19份携带QTL的SSSLs,其供体亲本是籼稻的有13份,供体亲本是粳稻的有6份。4、通过代换作图最后定位到11个耐低氧萌发QTL,包括6个正效QTL(加性效应百分率范围是6.8-11.2%)和5个负效QTL(加性效应百分率范围是12.8-18.8%)。在这11个QTL中,有8个QTL(qAG1、qAG2-1、qAG2-2、qAG5、qAG7-1、qAG7-2、qAG8和qAG9)与前人定位结果有重叠部分,其中qAG9已经被精细定位和克隆,另外3个为本研究新发现的QTL(qAG4、qAG6和qAG11)。5、本研究定位的11个耐低氧萌发QTL在染色体上分布较均匀,第2和7号染色体均有2个QTL,第1、4、5、6、8、9和11号染色体上都只有1个QTL,而3、10和12号染色体上并未检测到水稻种子耐低氧萌发QTL。综上所述,本研究以229份水稻SSSLs为实验材料,初步定位了11个耐低氧萌发QTL,将为培育优良直播稻品种提供更多选择,对于保障粮食安全具有重要意义。