目前，人们对自然保护区的关注大多集中在生物多样性上，较少有人关注生活在林缘社区的贫困人群。但是随着自然保护力度的加大，某些野生动物种群增加，野生动物损害庄稼的事件频频发生，使得自然保护与社区发展之间的矛盾与冲突加剧。遇到这种问题，受害人应该向谁索赔不仅是自然保护面临的重要问题，而且影响了农民收入，如果处理不得当还会影响社会的安定与和谐。本文正是基于和谐保护这一基本理念，从生态经济学、资源经济学、生态补偿学及野生动物管理学角度出发，希望在有限的范围内尝试评估野生动物肇事所造成的损失，提出合理的经济补偿方式及途径，为在更大范围内维护林缘社区农民的权益，逐步解决农民的生计问题，促进自然保护事业的可持续发展做出一点贡献。本文的主要内容有以下几个方面：(一)界定林缘社区、野生动物及生态补偿相关概念、分析自然保护区野生动物肇事的原因。(二)研究自然保护区野生动物肇事损失评估及生态补偿的相关理论和方法，提出野生动物肇事损失评估及补偿的原则、方法以及内容，提出了补偿主体。(三)以甘肃白水江国家级自然保护区三个自然村为案例，把损失评估的方法运用于实践，计算出了2006年的损失额及农民期望的补偿标准。(四)提出了解决野生动物肇事以及补偿损失的建议及政策。