目前,我国企业越来越多地参与到跨国企业合并的活动中,意在通过企业合并扩大企业的规模与全球市场占有率,同时也以获得被合并企业的知识产权为主要的合并目的之一。本文首先对于近期备受关注的数个跨国企业合并案例进行了分析,提出了企业合并中与知识产权相关的反垄断制度这一研究课题；进而,从法律理论角度分析知识产权与反垄断法之间的冲突,并进一步研究了在企业合并中知识产权与反垄断的冲突解决规则。我国相关的法律制度尚有欠缺,对其加以完善是我国反垄断法律发展的当务之急。本文提出我国应当明确知识产权在反垄断审查中的地位,应在企业合并将知识产权视作一般的权利,而不被直接认定具有垄断的效果,同时也需指出知识产权是审查所需考虑的重要因素之一。本文进一步说明我国反垄断法律制度中应当明确对于企业合并的反垄断审查中与知识产权相关的审查标准,这是控制企业合并制度的重要部分,有利于对于企业合并的反垄断审查公正、透明地进行。最后,本文以我国现有的反垄断法律体系为背景,为应对涉及知识产权的企业合并反垄断审查提供了可供借鉴的法律实务方面的建议。