植物内生真菌次级代谢产物是微生物次级代谢产物的重要组成部分,具有类型多样,生物活性丰富的特点。本论文从当归（Angelica sinensis）中得到的两株内生真菌拟康氏木霉菌（Trichoderma koningiopsis）和白耙齿菌（Irpex lacteus）进行了菌株鉴定,并系统地研究这两株真菌的次级代谢产物及其生物活性。本论文第一、二章主要对取材背景研究和目标菌株鉴定进行了系统阐述。第一章从药用植株当归入手,分析该植株中分离纯化得到的化合物种类及其具有的药用价值,并且简述生防菌的作用机制和菌种类别。第二章通过真菌宏观形态学生长情况观察（生长时间梯度）和分子生物学方法（邻接优化定位法等）的分析,将目标菌株MK 696749和MT 276332分别鉴定为拟康氏木霉菌（T.koningiopsis）和白耙齿菌（I.lacteus）。第三章对拟康氏木霉菌进行固体发酵,其中次级代谢物的化学成分进行纯化分离和鉴定,共获得17个单体化合物,包括5个新化合物konindines A-E,主产物为6+6双环聚酮类衍生物。新化合物都具有相同的基本碳骨架,仅是部分取代基不同且差向异构。在鉴定化合物konindine A-B时,采用了核磁数据确定碳骨架上的取代基的平面结构,单晶X射线结合ECD实验数据确定化合物的绝对构型。在探索单体化合物生物活性时,对此菌种的主产物进行生物活性分析,主产物对部分植物病原菌的抑制效果在256μg/m L（MIC）。konindine D的NO生成抑制活性为11.52±1.22(IC50μM)。第四章白耙齿菌次级代谢的固体发酵物的化学成分进行了分离和鉴定,得到16个化合物,且研究发现此菌种代谢产生的次级产物的主产物为5+7环海藻倍半萜,包括1个新化合物,其中本章还对此类倍半萜的生物代谢途径进行阐述,进一步揭示实验结果的可靠性。在鉴定新化合物时,主要采用核磁共振与DP4+构象优化和误差值分析对新化合物的构型进行分析。探究生物学活性时采用同类探究法时,主产物进行抗菌实验和体外抗乙酰胆碱酯酶的活性检测,其中化合物Ceriponol A的大肠杆菌抑制活性为128μg/m L（MIC）。本研究表明,当归植物内生真菌的次级代谢产物种类丰富,可作为真菌资源开发利用,从中分离得到更多较为复杂新颖具有药用价值的微生物次级代谢产物,进而丰富天然产物资源库。