稻属植物MULEs进化和狗尾草属植物MULEs表达状态分析

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玉米中的Mu转座子是植物中迄今为止已发现的转座活性最高,诱变能力最强的转座子。Mu同源因子(Mu -like elements,缩写MULEs)在植物中是广泛分布的。而且一些物种的基因组具有多个拷贝的Mu同源因子。在某些物种如小麦和水稻的cDNA文库中发现了mudrA的同源序列,预示着这些物种中存在着活跃的Mu转座子系统。本研究的目的包括:(1)研究稻属各种中MULEs之间的的进化关系;(2)研究日本晴中的MULE Os493的同源因子在野生稻中的分布情况;(3)分析狗尾草属植物中的MULEs转录水平的表达状态。主要研究结果如下:根据玉米的MudrA基因第二个外显子的保守区域设计引物,利用这对引物在稻属的16个种以及普通野生稻的18种材料中进行PCR扩增,结果在稻属的15个种以及普通野生稻(O.rufipogon)的18种材料中均得到一条600bp左右的条带。将这些条带克隆测序后,稻属不同种得到58个MULE片段的序列,普通野生稻得到15个MULE片段的序列。说明MULE在所分析的稻属15个种和普通野生稻的18种材料中是广泛存在的。进行同源性分析后发现序列间同源性非常高,预示着这些种中存在不久前曾转座活跃的MULE,并且种间有大量水平转移存在的可能性。对稻属不同种的58个MULE片段的序列进行进化分析后,将这些序列分为三类。利用特异性PCR和Southern技术得到日本晴中的MULE Os493的同源因子在稻属植物中的分布情况。大部分种在目的条带3kbp处有扩增产物和杂交信号。说明这些种中可能存在Os493的同源因子。而且克隆并测序了O.rufipogon和O.nivara的相应片段,均得到了和Os493同源性极高的序列,证明这两个和日本晴在进化关系上最近的AA基因组的两个物种中确实存在Os493的同源因子。根据法式狗尾草的一个全长MULE FA07-1基因片段(361bp)设计的引物,在狗尾草属植物中进行RT-PCR扩增。在豫谷1、轮生狗尾草W45、青狗尾草W56中均得到360bp左右的扩增条带。对轮生狗尾草W45的该片段克隆并测序分析后,确定这个片段在所取材料-轮生狗尾草W45的幼穗中转录水平是有表达的。
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