【摘 要】
：
亚历山大藻属（Alexandrium）是一类重要的赤潮甲藻，广泛分布于世界各地，其属下约一半为有毒种类。该属最早依据形态分类法建立，但由于随后形态分类法的分类标准不断更新，使得该属的分类地位众说纷纭。微卫星标记是近年来发展迅速的分子生物学技术，在遗传多样性分析、遗传图谱的构建和群体遗传学研究等方面应用广泛。鉴于此，本研究采用生物信息学的方法，从塔玛亚历山大藻的表达序列标签（ESTs）数据库中筛选微
论文部分内容阅读
亚历山大藻属（Alexandrium）是一类重要的赤潮甲藻，广泛分布于世界各地，其属下约一半为有毒种类。该属最早依据形态分类法建立，但由于随后形态分类法的分类标准不断更新，使得该属的分类地位众说纷纭。微卫星标记是近年来发展迅速的分子生物学技术，在遗传多样性分析、遗传图谱的构建和群体遗传学研究等方面应用广泛。鉴于此，本研究采用生物信息学的方法，从塔玛亚历山大藻的表达序列标签（ESTs）数据库中筛选微卫星（Simple Sequence Repeat，SSR）位点，设计SSR引物，利用毛细管电泳对4株塔玛亚历山大藻（Alexandriumtamarense）、2株相关亚历山大藻（Alexandrium affine）和1株链状亚历山大藻（Alexandrium catenella）进行了种内、种间遗传多样性分析，获得以下主要结果：1)从6830条非冗余的ESTs中共查找到222个SSR，平均每18.5kb就有一个SSR，三核苷酸重复在所有的重复类型中所占比例最大，达到48.2％，重复单元CTG／CAG出现频率最高。进一步筛选出12条SSR引物，用于遗传多样性的分析。2)遗传多样性分析结果显示，种内遗传多样性水平整体偏低，多态性引物比率仅为41.67％，Nei’s基因多样性平均为0.2130。种间遗传多样性水平较高，多态性引物比率为75％，Nei’s基因多样性平均水平为0.4643；另外，种间遗传分化系数较高，平均水平为0.7051。3)对7个样品的聚类图分析发现，A．tamarenseCCMP116与A．affine CCMP112遗传距离非常接近；A．tamarense ATHF9301、CCMP1598和ATDH01相互聚在一起，表明为同种藻；A．catenella ACDH01与A．tamarense分属两枝，确定为不同藻种。以上结果表明，SSR标记在亚历山大藻遗传多样性分析方面是一种非常有用的工具。
其他文献
目的本研究基于中国学生体质与健康调研数据,探究1985～2014年我国7～18岁汉族学生视力不良的流行特征及增长趋势;应用秩和比（rank-sum ratio,RSR）法、TOPSIS（technique for order preference by similarity to an ideal solution）法及两者模糊联合法综合评价2005和2014年部分少数民族学生视力不良状况及评价效
目的:本研究旨在通过对比催产素的不同用药时间窗对孤独症（autistic spectrum disorders,ASD）模型鼠前额叶皮质细胞外信号调节激酶（extracellular signal-regulated kinase,ERK）磷酸化水平及c-Fos蛋白表达的影响,探究孤独症模型鼠前额叶皮质ERK、p-ERK、c-Fos蛋白表达量的动态变化,以及催产素改善孤独症社交障碍的最佳用药时间。
目的:研究孤独症谱系障碍（autism spectrum disorders,ASD）儿童外周血淋巴细胞MAPK/ERK信号传导通路中丝裂原活化细胞外信号调节激酶激酶（mitogenactivated extracellular signal-regulated kinase kinase,MEK）与细胞外信号调节激酶（extracellular signal-regulated kinase,E
目的:探究纳米复合材料Ce/Ag/ZnO对口腔常见菌（白色念珠菌ATCC90028）的氧化应激抗菌机制,为此类无机纳米抗菌剂在口腔疾病治疗中的应用提供理论依据。方法:本实验采用二倍稀释法将纳米复合材料Ce/Ag/ZnO稀释成浓度为0.625mg/mL、0.313 mg/mL、0.156 mg/mL、0.078 mg/mL、0.039 mg/mL的溶液,通过比浊法、琼脂培养法检测其对白色念珠菌的最低
目的：本研究所已从一株Armillariella tabescens E-20菌株分离得到一种能够去除黄曲霉毒素的蛋白酶，命名为黄曲霉毒素解毒酶（Aflatoxin-detoxifizyme，ADTZ），该基因全长cDNA已被克隆，并已实现其在毕赤酵母表达系统中的分泌表达。研究已经表明：黄曲霉毒素解毒酶（ADTZ），是一种具有氧化还原作用的新加氧酶，但是对黄曲霉毒素解毒酶的结构和功能的了解甚少，虽
目的:本实验通过测定圆柱瘤基因（cylindromatosis,CYLD）和白细胞介素-6（Interleukin-6,IL-6）两种因子在结直肠不同组织中的阳性表达情况,分析其关系及与临床病理特征的相关性。方法:通过对选取的组织标本并结合病理结果将其分成四组,依次为CRC组、HGIN组、LGIN组、Normal组。利用免疫组化法（Immunohistochemical,HIC）测定CYLD、IL
目的:探究缺氧缺血性脑病大鼠模型中钙敏感受体（calcium-sensing receptor,Ca SR）对钙调磷酸酶/活化T细胞核因子（Ca N/NFAT）通路的调控作用,研究缺氧缺血性脑病（hypoxic-ischemic encephalopathy,HIE）脑损伤后的免疫机制,为防治和减轻HIE的神经损伤提供新的思路。方法:随机选取150只7日龄健康清洁级SD大鼠分为6组:假手术组、HI
目的:体外研究多级孔二氧化硅微球（MPSNs）通过负载不同浓度的淫羊藿苷（ICA）对成骨细胞增殖分化的影响,为后续构建纳米复合支架材料应用于骨组织再生提供理论依据。方法:选用含两种不同孔径的MPSMs作为药物载体,利用物理吸附方法将ICA负载于MPSMs上,得到MPSMs-ICA复合物。以MC3T3-E1为细胞模板,碱性磷酸酶染色检测MC3T3-E1细胞的成骨分化能力。以MPSMs为对照组,实验组
为了研究脊椎动物脂蛋白脂酶（lipoprotein lipase，LPL）、肝脂酶（hepatic lipase，HL）基因结构与功能关系及其分子进化关系，我们克隆了文昌鱼（Amphioxus）、中华鲟（Chinese sturgeon）、鲢鱼（Silver carp）、鳙鱼（Bighead carp）、草鱼（Grass carp）、罗非鱼（Tilapia）和鳜鱼（Chinese perch）LP
目的:通过建立新生Sprague-Dawley大鼠缺氧缺血性脑损伤（Hypoxic-ischemic brain damage,HIBD）的动物模型,测定HIBD不同时间点脑组织中NLRP1、Caspase-1、IL-18的表达及给予静注人免疫球蛋白（IVIG）干预后对NLRP1-Caspase-1-IL-18通路表达的影响。方法:（1）选择7日龄清洁级SD大鼠96只,随机分成3组,Sham组,H