16s-rRNA测序技术在儿童慢性鼻窦炎伴腺样体肥大中的细菌定植初筛分析

来源 :昆明医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wergsdf
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[目 的]通过16Sr-RNA二代高通量测序技术分析儿童慢性鼻-鼻窦炎(CRS)与腺样体肥大(AH)之间的鼻咽部微生物群落组成,为进一步研究儿童CRS微生物学、儿童CRS及AH之间的鼻咽部微生物类群差异性及其潜在的致病菌群相关性提供理论基础及实验依据。[方 法]在我院门诊连续登记了 45名诊断为慢性鼻窦炎、腺样体肥大或两者兼有而导致打鼾、鼻塞的儿童,分别纳入CRS、AH或AH+CRS组,其中CRS组14名,AH组20名,AH+CRS组11名。从符合纳入标准的患儿处获取鼻咽拭子样本。所有样本进行测序前预实验筛选后,通过16Sr-RNA二代高通量测序技术检测并读取样本中的碱基信息。对得到的生物信息进行(1)操作分类单元聚类;(2)Taxnomy物种注释划分微生物类群分类学水平;(3)样本多样性(Alpha)分析解析总体样本的微生物多样性;(4)β分析了解各组间微生物的相对丰度差异。[结 果]结果显示CRS及AH患者鼻咽部均有含量丰富的细菌群落,生物信息学分析表明:(1)总体样本共获得9251个OTU。(2)在分类学门(Phylum)的水平上变形菌门是所有样本中最丰富的门类、其次是厚壁菌门和放线菌门。在科(Order)水平上,假单胞菌科、肠杆菌科、乳酸杆菌科、棒状杆菌科、根瘤菌科、拟杆菌科、葡萄球菌科、链霉菌科、巴斯德氏菌科更为丰富;而在属(Genus)的水平上,假单胞菌属、不动杆菌属、莫拉克斯氏菌属、棒状杆菌属、大肠杆菌志贺菌属、葡萄球菌属、链霉菌属、嗜血杆菌属、狡诈球菌属则是相对丰度最高的。(3)在样本多样性方面,CRS组及AH+CRS组的Alpha多样性相较于AH组有显著的减少,组间Alpha多样性具有统计学差异(P<0.05)。但CRS组与AH+CRS组之间没有观察到显著的分离,Alpha多样性指数并无统计学差异(P>0.05)。(4)各组具有相对丰度差异的细菌类群:CRS组中巴斯德菌科、巴斯德菌属、拟杆菌科、葡萄球菌科、葡萄球菌、乳酸杆菌科、疣微菌门、梭芽胞杆菌属相对丰度更高;AH组中链霉菌科、放线菌属、肠杆菌科、链霉菌属、变形杆菌属、甲型变形杆菌、拟杆菌科、拟杆菌门Unassigned、Erwiniaceae、链霉菌属、丙二酸杆菌科、相对丰度更高;而AH+CRS组中Yersiniaceae、黄杆菌、威克斯氏细菌属、Elizaberthkingl、醋杆菌、放线菌科、放线菌属、甲型变形杆菌相对丰度更明显。[结 论]鼻窦炎及腺样体肥大患儿鼻咽部均存在丰富的细菌类群,儿童鼻窦炎患者的鼻咽部微生物多样性相较腺样体肥大患者有所降低。儿童鼻窦炎组中相对丰度最高的是拟杆菌科、葡萄球菌科、葡萄球菌、乳酸杆菌科、疣微菌门、梭芽胞杆菌属。
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