进入21世纪以来,国内外学者对于空间结构的研究进入了一个全新的阶段,各国结合自身的国情以及自然资源的特点制定出不同的发展方案。其中,我国在结合自身发展的基础上,制定出国土空间规划的方案,而国土空间规划是空间结构发展的行动指南,此外,在结合国土空间规划中针对不同地区主体功能的不同,提出了主体功能区规划的概念,并在十三五规划中提出了关于主体功能区规划的相关指导理论,其中有“按照主体功能区规划的相关要求,加强区域之间的协调发展,推动其合理有序的发展,加强国土空间结构的科学规划与开发,从而达到完善区域发展的政策要求以及经济发展布局^[1]”,玛纳斯河流域在发展的过程中,存在区域区位的争夺,如玛纳斯河在区域的归置上存在的管理权的争夺,流域内上下游水资源的配置问题,流域内人地关系问题等等矛盾突出。文章是基于国土空间规划视角下对玛纳斯河流域的空间结构进行分析与研究,主要从国土空间规划中的三类空间来进行研究分析,其中在文章相关研究中涉及到社会经济发展水平分析、人口与城镇化发展水平分析以及国土空间中土地利用的发展变化分析,结合流域内各地区城市规划进行科学客观的分析,总结流域内自2001年以来玛纳斯河流域的经济发展过程以及城镇化发展过程、土地利用变化程度、流域内空间结构现状等,梳理现实存在的主要问题,并以此来分析总结流域内国土空间结构布局以及存在的区域空间布局问题。文章总体采用了“生态空间发展演变─城镇空间格局与过程分析─农业空间变化演变─空间结构识别─空间结构功能布局与优化”的研究思路。研究得出:（1）玛纳斯河流域内社会经济和城镇发展空间分布格局初步形成,以石河子为发展中心的石玛沙城镇组团也已初具雏形,但是中心发展区对周边县域发展的带动性不够强,市域内以及县域中心发展区对乡镇之间发展的辐射带动性较弱,在经济发展过程中存在资源环境的争夺,这主要是由于在流域的管理上存在的职能不明确、不清晰而引发的矛盾,且不同的地区在规划层面存在一定的空间错位与边界模糊的情况,区域内部的空间发展衔接不够紧密,在兵地融合方面存在一定的矛盾,市县之间的发展缺乏协调规划;在土地利用与管理上,存在不合理利用以及过渡开采的情况,使得人地关系矛盾较为突出。结合人地关系系统理论分析,影响玛纳斯河流域内空间布局的因素主要有“约束”-“驱动”两个方面,即自然因素以及人文因素,其中,对于土地资源利用效率的不足以及不合理利用的方式使得土地资源匮乏,从而限制其自身的发展,而关于政府政策引导以及经济利益的诉求是促使国土空间开发的主要驱动因素。（2）结合玛纳斯河流域内空间分布格局以及对于未来在天山北坡经济带的发展定位,玛纳斯河流域内城镇发展采用“一极多轴”以及“点-轴-面”的空间综合开发模式,进而推动城镇组群及乌鲁木齐都市圈社会经济以及资源环境的可持续发展,从而形成多核心、多轴、多副中心的国土空间格局,为新疆社会经济以及自然资源的可持续发展奠定一定的理论基础。（3）结合玛纳斯河流域内不同功能区分布模式、开发密度以及未来发展潜力,并根据《全国主体功能区规划》及《新疆主体功能区规划》等外部发展要求,提出优化后的空间结构呈现“三区一带两核”的整体格局。根据“非均衡协调发展”的思路对玛纳斯河流域进行梯度发展的策略。在流域中游地区依托乌鲁木齐都市圈的发展,发挥乌鲁木齐、石河子市“双核”的带动作用,大力发展第三产业。而在流域的上下游作为生态保护的主体功能区,建议立足资源优势,发展特色生态产业以及特色农业产业,优化流域内产业结构,促进其经济发展,改善居民生活条件。