日本血吸虫新基因的筛选及S.jElonginC基因结构和功能的研究

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目的:采用表达序列标签(EST)法随机筛选日本血吸虫(中国大陆株)成虫cDNA文库,获得日本血吸虫成虫ESTs;将获得的ESTs通过互联网登录GenBank并进行了同源性分析;对部分具有潜在功能的克隆进行序列的通测,获得其全长cDNA序列,并推导这些基因可能的开放阅读框.在此基础上对日本血吸虫新基因RNA聚合酶Ⅱ转录延长因子S.jElonginC进行结构和功能的生物信息学研究和有关功能的实验研究.结论:1获得138个日本血吸虫成虫表达基因的EST,并获得134个dbEST/GenBank登录号.同源性分析发现92.8﹪为日本血吸虫未知基因EST.这些未知基因包含的生物信息为日本血吸虫新基因的发现提供了新资料.2成功克隆到3个新的日本血吸虫全长cDNA序列,即S.jElonginC、S.jADP-核糖基化因子以及S.j类诊断抗原分子28.为进一步研究其功能奠定了工和基础.3S.jElonginC蛋白质一、二级结构、三维模体等生物信息学分析结果表明该氨基酸具有较好的抗原性,其可能的抗原表位主要在氨基端氨基酸残基的8~20、52~62、88~99等三个区域;VHL-ElinginC-ElonginB复合体与目的蛋白S.jElonginC拟合最优的模板蛋白,同源性达到85.8﹪.4原核重组表达的S.jElonginC能被免疫兔血清识别,提示该表达产物保持了S.jElonginC的天然构象,并且具有免疫原性.5反义核酸实验证实S.jElonginC基因的反义ODN具有抑制人类肾透明细胞癌株786-0增殖活性的作用.提示S.jElonginC可能在转录延长过程中发挥作用.
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