目的棘阿米巴属Acabtgamoeba sp.的阿米巴是广泛存在于土壤、淡水、海水、腐败物等生活环境中的自由生活阿米巴(Free-living amoeba, FLA),可引起棘阿米巴性角膜炎(Anthamoeba Kratits, AK)外在免疫功能低下的人群中可引起肉芽肿性阿米巴性脑炎(Granulomatous Aoebic Ecephalitis, GAE)、肺部感染、皮肤病变、鼻窦炎或弥漫性感染。棘阿米巴还可做为部分致病性细菌的载体而受到学者们的广泛关注。我们从自然环境的土壤和水体中分离出6种棘阿米巴虫株,其中从北京地区土壤中分离的棘阿米巴(Acanthamoeb sp.) CB/S1株细胞内发现了内共生细菌。本学位论文,通过形态观察和基因测序,分析和鉴定Acanthamoeb sp. CB/S1株细胞的内共生菌。方法从北京地区土壤中分离的Acanthamoeb sp.CB/S1株PYG培养,用地衣红-卡红染色对共生菌进行形态染色观察；用常规氯仿-酚提取基因组DNA,测序内共生菌的16S rDNA基因序列。利用GenBank的BLAST功能进行菌种鉴定,分子生物学软件ClustalX构建进化树。结果地衣红-卡红染色,Acanthamoeb sp.CB/S1株内共生细菌呈黑色、棒状,在胞质内不规则地分布。CB/S1的共生菌的16S rDNA基因序列长度为1534bp。利用GenBank的BLAST结果,CB/S1的共生菌的16Sr NA基因序列与因库中的Candidatus Amoepophilus asiaticus 5a2细菌具有98%的同源性；同时与Acanthamoeba sp. KA/E21的共生菌亦有98%的一致性。结论棘阿米巴CB/S1的共生菌为Candidatus Amoepophilus asiaticus 5a2。