产学研合作组织是基于优势互补、风险共担和利益共享原则建立的联合体。本文通过分析产学研合作产生和发展的原因、产学研合作的基本理论和特点，探讨了实现产学研合作的基本模式。本文的主要内容是应用公司治理的基本原理和方法，对产学研合作中的治理问题进行研究；分析了产学研合作共同体的治理边界、治理结构和治理机制；其中重点是产学研合作中的治理机制问题。　　 产学研合作模式具有多样性的特点，本文提出按照现代产权理论将产学研合作模式划分为三种基本类型：合作型产学研合作共同体、合资型产学研合作共同体和一体化型产学研合作共同体。产学研合作共同体具有知识转移和组织学习的特点，是一个学习型组织。同时合资型产学研共同体具有高科技公司的特点。因此，在其治理机制设计时要考虑应用高科技公司治理的方法，尤其重视激励机制中对核心技术人员的激励作用。产学研合作是一个多方参与的过程，参加合作各方资源优势不同、合作目标和利益诉求存有差异。因此，对产学研合作共同体的治理，一方面要保护各方的利益；另一方面还要防范合作方机会主义导致的企业效率的降低和合作关系解体的危险。产学研合作类型的差异，要求其治理模式的选择除应用常规的正式的治理机制以外，还要注意发挥非正式治理机制，如信任机制、文化机制、市场机制等的作用。产学研合作共同体既要有完善的内部治理机制，又要高度重视外部治理机制的作用。随着产业同盟治理理论、网络组织治理理论、创新型组织治理理论等新的治理理论研究的不断深入，产学研合作的治理理论也将会不断取得新的成果。