DNA甲基化调控rs2200733与心房颤动相关性的初步观察

来源 :新乡医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chen_d031
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背景经典遗传学认为某些单核苷酸多态位点(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与房颤具有强相关性,例如rs2200733,但其分子机制还不清。此外,大量研究已经报道了表观遗传学可能参与SNPs与表型关系的调控,例如DNA甲基化,但其与房颤的相关性报道罕见。通过查阅文献,未发现有关于rs2200733位点附近DNA甲基化与房颤的相关报道。目的探索rs2200733在中国中原地区汉族人群中对房颤的影响,以及位于rs2200733下游的两个CpG位点的甲基化程度是否与该SNP位点具有相关性。方法在郑州市第七人民医院心血管内科从2016年9月至2017年6月的住院患者中筛选出238名患者,分为房颤组和窦律组。对所有患者采集外周静脉血并提取DNA,使用突变阻滞扩增系统(amplification refractory mutation system,ARMS)法对rs2200733进行基因分型。在上述分组中随机选择57例房颤患者和110例窦律患者,进行重亚硫酸氢盐处理和焦磷酸测序。全部病人的相关临床资料从医院病历中获取。结果病人的临床资料分析显示其性别、年龄、冠心病(CAD)、糖尿病(DM)、脑卒中、左房内径(LAD)和左室射血分数(LVEF)对房颤有影响。经由卡方检验发现在五个遗传模型中,rs2200733与房颤具有明显的相关性,尤其是在隐性模型中(OR:2.396,95%CI:1.336 to 4.297,P=0.003)。利用在线基因型分析软件SNPStats,经过校正性别、年龄、CAD、DM、脑卒中、LAD和LVEF后仍然发现在隐性模型中,SNP在房颤组和窦律组存在显著差异(OR:4.75,95%CI:2.07 to 10.91,pSNP<0.0056)。通过甲基化实验,检测到CpG1和CpG2均高度甲基化。根据二元logistic回归分析的结果,发现上述两个位点与rs2200733不相关,即对房颤没有影响(P>0.025)。结论在中国中原地区汉族人群中,rs2200733的分布与该位点在亚洲其他人群中的分布相一致,并且rs2200733和房颤具有相关性。位于rs2200733下游的CpG1和CpG2位点的DNA甲基化与该SNP无相关性,并可能没有参与到SNP对房颤的调控机制当中。
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